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问题 各位老师好,我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析,该家族中有29个相关基因,我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号,然后下后通过hmmsearch 分析,但结果只有25个相关基因,请问是怎么回事?问题出在哪里?

问题 泛基因家族分析绘制kaks>1率分布的热图

可以将kaks_greater_than_1_gene_rate.txt中,比值为0.0的WRKY成员删除,然后绘制热图

问题 求助!我在学习老师的基因家族分析时,使用代码进行复制文件时总是报错找到文件!!!!!

我在学习老师的基因家族分析时,使用代码进行复制文件时总是报错找到文件!!!!!

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问题 医学癌症TCGA-生存分析课程相关问题-表达数据cpm计算log标准化后数据为什么变成了负值?

医学癌症TCGA-生存分析课程中基因表达数据处理时通过cmp对表达数据进行标准化处理 我分析的是mRNA的数据 运行下面代码,得到的数据如下图 norExpr <- DGEList(counts=datExpr)norExpr <- calcNormFactors(norExpr) 运行下面的代码后,得...

文章 在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

... mirdeep_runs/run_04_09_2023_t_17_09_26/tmp/precursors.str 原因可能是版本更新,参数有改动。将--noPS参数改为-noPS之后就可以正常输出文件了。

问题 求助,进入docker数据分析是设置共享文件出现问题

按照教程一步一步来的,文件名也是正常设置,是因为我的用户名是中文吗

问题 你好,请问小麦基因组中的Un是能用于串联重复和片段重复分析?谢谢

能做串联重复的话,做大片段重复和共线性分析可以吗?还是Un序列上的基因只能以同源基因来说明,谢谢老师

问题 基因家族分析的文章被人提问为什么最长的基因对应的是最大的蛋白

基因家族分析的文章被审稿人提问一基因一蛋白,为什么最大的蛋白对应的是最长的基因,如果存在可变剪接是怎么确定这个长度的? 我个人觉得是存在可变剪切

文章 R语言基础入门—矩阵介绍

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

文章 IF=9.4|多组学解析大口黑鲈高温胁迫适应机制

...tive responses of largemouth bass to high temperature stress”的多组学分析文章。”大口黑鲈是重要经济淡水鱼,全球变暖导致高温胁迫发,引发其死亡率上升、养殖损失加剧,但高温适应调控机制研究匮乏。通过多组学及形态生化分析,...

文章 R数据集合并

...非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,需要指定任何公共索引时,可以采用cbind函数下图是cbind的用法: 2.rbind 下图是rbind用法: 两个数据集的变量必须相同,顺序可以一致。合并后,结果会按照第一个...

问题 构建好的进化树怎么进行结果分析那?谢谢!

各位朋友、老师您好,应用MEGA5构建好的进化树后,在结论和讨论部分应该如何进行写那?另外怎样从进化树中将同的序列进行分类?谢谢!

问题 医学癌症TCGA-差异基因表达分析课程代码报错

老师您好,我按照课程里面的代码,运行到保存数据的时候出现了报错,麻烦您帮我看下这个问题咋解决呀,我看懂什么原因,谢谢了

问题 基因组间共线性分析作图问题

已经做出来图了,也在图上用红线显示了共线性基因,但是由于该物种原基因组染色体命名问题(染色体名字很长),导致作图时染色体名字重叠,有没有办法解决啊,或者直接把染色体重命名为1234这种