找到约 15 条结果

问题 动植物泛基因组分析实操课程资料问题

在动植物泛基因组分析实操课程中，首先，发的百度网盘的资料中ara_pangenome/01.prepare_data文件夹解压出来是空的；其次，运行01.prepare_data.sh命令时，出现错误，而且我发现教程中的演示（在动植物泛基因组分析实操课程，中的数...

问题 R 语言批量做相关性分析correlation

有很多基因，测了转录组和蛋白质组，需要看看基因之间的相关性，基因太多能批量求每个基因的相关性吗？

问题 进化分析时如何再分为几个亚家族

老师，我想得到如下图片：我做的进化树不是这种圆形的，是需要其它的软件吗；另外根据什么再进一步分成亚家族啊？ 

问题 请问老师有基础教学肿瘤二代测序生信分析课程吗？

新手想学习

问题 R 语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析correlation

两组共6个样本，上千个差异lncRNA 、mRNA，表中数据是RPKM值，如何用R语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析？cor函数输入文件是什么格式？

问题 老师，我在做共线行分析时，出现这种情况，该如何解决

明明里面有这个文件

问题 求助，扩增子测在OTU分析时，这一步报错~

求助大佬，在扩增子测序时，使用assign taxonomy.py报错

文章 如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

...看到。 二、如何从GWAS结果中获取解释率PVE gwas关联分析可以使用很多软件，也可以计算各种模型。接下来主要说明TASSEL和GEMMA怎么得到解释率 1.TASSEL TASSEL是可以直接得到pve值的，直接使用数据即可 1.1 GLM模型 marker_Rsq ...

问题 WGCNA分析中模块与性状相关性与MM vs GS相反？

WGCNA分析中，在某红色格子里成负相关(p<0.05)，然后在做Module membership vs. gene significance时，结果反而为正相关，也有意义，可以帮我解释一下吗？性状都是二分类，0，1. 谢谢！

问题 使用plink做pca分析时报错

你好，我在用使用plink做pca分析时报错。 Error: Invalid chromosome code 'chr27' on line 30616892 of .vcf file.(This is disallowed for humans.  Check if the problem is with your data, or ifyou forgot to define a different chromosome set with e.g. --chr-set.) 使用的命令如下： ...

问题 RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗

有参转录组课程的代码可以用来分析全转录组数据吗，lnRNA,miRNA这些也可以用hisat2注释吗

文章 qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

... \  --i-data repset-seqs.qza \  --o-visualization rep-seqs.qzv# 下载qzv在线查看，dada2只有1千多个ASV 课程推荐：微生物扩增子分析课程实操     微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

问题 您好，alpha和beta多样性分析sampling-depth 16900如何确定？

###alpha和beta多样性分析 qiime diversity core-metrics-phylogenetic \   --p-sampling-depth 16900 \ 这个16900是怎么确认的？云课堂视频课程这部分被剪掉了，跳了3分钟

问题 差异基因数量太多，通过GO富集分析筛选一部分，再进行蛋白互作，可行吗？

...不同时间点的样本转录组FPKM数据。 第一步、通过主成分分析选出10000个基因（共50000个），另外，通过STEM趋势分析得到两组显著差异的集合分别包含18000个基因和5000个基因。 第二步、分别对这3组基因集进行GO富集，筛选出层...

问题 老师，两个物种间共线性分析最后一步报错了

报错信息 之前生成的文件