问题 进化树+motif+基因结构采用之前课程中介绍的TBtools把三者合成一个图的时候，基因名字重叠（分析用的序列数154条），看不清，图中字体大小无法批量修改！PS:输入少量序列进行分析，物种基因名字不会重叠，能看清这种情况怎么处理呢？

问题 老师您好，我这边在处理扩增子数据分析时，进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault，用您那边提供的样本数据也是有这个报错，请问怎么解决呀！

问题 老师，我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候，只显示一部分基因的顺式作用元件，另一部分只有CDS。我试过单独贴每一个基因，是可以的。这种情况该怎么办？（ID检查过了，也更换浏览器，都不行）

问题 老师您好，我用您线下课给的TCGA生存分析cox模型代码时，在外部验证时，外部验证的数据集整体表达水平偏高，会不会导致risk值整体偏高，那么cut_value怎么去确定呢？进而分为高低风险组呢？

我看到有的文章使用的表达之经过Zscore，我想问下老师您对这样的方法有了解嘛？谢谢老师！

问题 http://genome-e.ibrc.or.jp/home/bioinformatics-team/mutmap

您好，可以发一份这个软件吗？

文章 超大基因组，超长染色体，凤丹牡丹基因组怎一个难字了得！

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问题 想请教一下一个问题，用R做WGCNA的Module−trait relationships相关性热图时候，按照官网教程，就出来了这样的图，每个格子太小了，然后我用普通做热图的命令 cellwidth = , cellheight =，也不能行。请问这个要怎么调整呢

问题 老师，我用hmmsearch 没搜索出结果，然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析，比对出来的基因只有几个，我老师说我要做的基因有200多个，完全对不上，不知道该怎么办了，请教下老师。

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...今天学霸姐姐给大家梳理一下： Nature Communications 是一本怎么样的期刊? 首先，大家要知道，我们通常所说的Nature，其实是出自于Nature出版集团， Nature出版集团是英国的一家出版公司，本质上是一家公司，公司要盈利， 因此...

问题 http://genome-e.ibrc.or.jp/home/bioinformatics-team/mutmap

您好，可以发一份这个软件给我吗？

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 需要测序多少合适？

...数据来说话。 以人类的Universal Human Reference RNA（来自10个细胞系，增加样本内基因的多样性）为例，分别统计在不同测序量1cell 到 10个cell的情况下，基因和转录本的覆盖情况。 1. 基因的覆盖情况： 下图展示了 随着测序量的增...

文章 欢迎加入组学大讲堂问答社区

...解读中肯定会遇到很多问题，如：转录组中基因表达定量怎么做？如何筛选感兴趣的功能基因？候选基因如何验证？等等。不管是实验的、数据分析的还是结果解读的问题您都可以到问答社区中提问，总会有牛人为您解答；目前...

文章 R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

...的相关性的，这个结果里也有显著性检验的p值 输入文件格式见例子中的df1与df2 library(psych)cor.result <- corr.test(df1,df2,method = method,adjust = adjust)result.r <- cor.result$rresult.p <- cor.result$p 但是如果有时候数据量非常大，比如有上...

文章 grep --color=auto使用用法介绍

...符串并进行区分，提高效率。 grep --color=auto的基本命令格式如下： grep --color=auto '字符串' 文件名 其中，字符串为搜索的目标字符串，文件名为要搜索的文件名。 grep --color=auto默认的颜色为红色，在黑色的背景上比较显眼。但...