...CC/MF)、''ID"(GO ID)、"term"(功能描述)、"adj_pval"(校正后的p值)和"genes"(每个GO term中含有的gene ID): categoryIDtermGeneRatioBgRatiopvalueadj_pvalqvaluegenesCountBPGO:0006979response to oxidative stress10/37458/188661.25E-081.79E-051.27E-05TXNIP/FANCD2/ANGPTL7/NOX4/NCF2/HSPB1/P...
在自然演化过程中,多倍化和全基因组复制事件常常被被认为是物进化的推动力,它们为生物进化提供了原始的遗传材料,同时也导致了物种的倍性差异。倍性直接影响基因组的大小和复杂性,不同倍性的物种需要不同的组装策...
...aestivum L.)的文章,一起来学习下基因家族分析后续实验该怎么做! 背景介绍 TCP基因家族是植物中特有的一类转录因子基因家族,参与植物生长发育、抗逆应答等的多个生物学过程。TCP基因家族的进化和功能已在多个物种如苹...
... col.link = 2, link.width = 2, # 单倍型之间连线的颜色和宽度 main = "HapNet", # 主标题 pie.lim = c(0.5, 2), # 圆圈的大小 legend_version = 1, ...
...了生物医学”。 在很早之前,欧美多个国家的科学家一起建立了“14天规则”。 14天规则的意思是说:科学家只能在不满14天的胚胎上进行实验。 因为14天之前的人类胚胎还未分化出神经等结构,尚不具备人的特征,因此不...
...个目标我们必须做什么”。 所以“O”和“KR”浓缩在一起就是“为确保达成企业目标的关键成果分解与实施”。 二、那些牛逼的公司为什么都推崇OKR 我有个朋友,在一家互联网公司做HR,他们公司在引入OKR之前,推行的...
...on-file srr.txt -O /opt/user/ncbi 提示unrecognized option: '-a' 请问怎么才能用到aspera呢
...里我们更新了课程,可以批量提供基因对列表(串联重复和大片段复制),就可以快速批量的进行kaks计算,其中用到的重要工具为Para AT,文献如下: ParaAT工具介绍 ParaAT是中科院基因组所的张章教授课题组开发的工具,该工...
...来减少误差。双染色技术是把两个样本用不同荧光标记后一起杂交到同一张芯片上。用于检测两种不同条件下基因表达的差异情况,如疾病组织和正常组织(往往多个正常组织DNA混合在一起,作为”pool“样本);处理组与对照...
... 1.1 (a)将所有物种的全部蛋白序列通过序列比对和调用MCL聚类实现同源分类,推断出同源基因集合(Orthogroup); 1.2 (b)基于每个同源基因集合(Orthogroup)进行构建基因的进化树(Unrooted gene trees); 1.3 (c/d)...
...于高维度数据中多重集合交集的可视化。它是传统Venn图和集合图的替代方案,特别在集合数量较多或交集较复杂时,更加清晰和实用。Upset图的应用广泛,常见于生物信息学、统计学、数据科学等领域。 读入文件 mydata<-read...
老师,您好,根据咱们转录组课程进行了实操,质控等正常,但是转录组数据比对到基因组这个步骤总是出现比对率只有零点几的情况,尝试了好几个转录组数据,从来没正常过。 水稻转录组测序数据显示如下,NCBI下载的单端...