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问题 老师您好,我在安装GraphPad Priam时,老是出现如下问题,换了几个下载地址都是这样的问题,一直安装不了。求解决方法!!!

问题 老师你好!想要鉴定NF-Y基因家族,文献提到可以KOG开头的几个基因为参考序列,鉴定目标物种的NF-Y家族成员!文献提到的模型在哪儿可以下载呀?

文章 如何利iTOL绘制漂亮的进化树

...GNNHRR VGFQGRNQQSMGVEKGFPPSKMKQVYVPKQTTGS 1.2拖拽test.fa到MEGA-x 也可以选择粘贴,粘贴的时候选择你比对的序列,此处为蛋白 1.3 比对 比对-->输出*.meg 1.4将输出的.meg文件拖拽会MEGA-X 选择构建邻近(NJ)系统发育树 bootstra...

问题 我按照链接文档安装,但是都失败了。我我同学的电脑安装一次就成功了。想知道我电脑为什么安装不了的原因。

文章 R的几个内置常量

R里面有几个内置常量,方便我们直接调而非创建: 想要了解R的内置常量,可以?Constants 命令查询: ?Constants 其常量如下: 1、26个字母LETTERS, 小写字母怎么办? 有letters > LETTERS [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "...

文章 抗体Fab段的主要功能及制备方法

...淋巴细胞或浆细胞产生的免疫球蛋白,它在人体免疫系统扮演着重要的角色。抗体能够识别并结合抗原,从而启动补体级联反应或通过Fc段与效应细胞结合,引发免疫应答。抗体由轻链(L)和重链(H)组成,每条链都分为恒...

问题 老师!求解答!在TCGA数据基因ID转换出错!!

> Ensembl_ID_TO_Genename <- get_map("../gencode.v34.annotation.gff3")  Treat input as file |--------------------------------------------------| |==================================================| Warning message: In data.table::fread(input, header = FALSE) :   Stopped early on line 26...

问题 请问老师,多个物种的转录组pep数据可以进行比较组学基因家族聚类、扩张收缩等的分析么?

问题 您好,老师,我这段代码想实现个循环,可只输入fd文件的第一个数据,就输出了,实现不了循环,麻烦老师给指导一下,谢谢老师

问题 老师,您好,请问我的基因组下载不了GTF文件,有的是gff3文件,文件如下,不知道是否可以拿来尽力索引?

我建立的索引得到的是以下文件,其splicesites.tsv文件是空的,不知道什么原因,是不是gff3文件有问题啊?

问题 请问在做SSR分析circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢,完全粘贴课程内容的conf配置文件

文章 sort -V | 对字符和数值组合的排序

...使-n选项就达不到我们想要的效果了,这时候需要使-V选项 #cat 2.txtchr1chr12chr123chr2chr34chr3chr5chr5678chr10chr11 #sort -n 2.txtchr1chr10chr11chr12chr123chr2chr3chr34chr5chr5678 #sort -V 2.txtchr1chr2chr3chr5chr10chr11chr12chr34chr123chr5678 ...

文章 计算Kaks时批量提取多对基因的序列

基因家族分析,在计算kaks时需要将每组串联重复基因序列提取出,然后分别进行多序列比对。 我们给大家提供的脚本只能一对一对的提取序列,那数量少还可以,可如果串联重复基因太多就有些麻烦了。这里提供一个批量提...

问题 群体遗传进化课程基于piR脚本绘制曼哈顿图请问更改色板颜色的具体指令

...怎么改都会报错无法识别颜色名字,起初我以为是其他包的颜色无法识别, 后来使了默认的四个颜色,也了ggplot2包自带的色版,都不可以,应该是代码没输入正确,请老师帮忙看看,谢谢!

问题 老师好,我在虚拟系统筛选出53个基因,去两个网站上比对结构域,结果不同且差异较大,我选择了pfarm网站的53个基因。但是再构建进化树时邻接法却提示我序列差异太大,画不出来。然后我删掉了序列很短的基因6个。就画出来了。请问老师,我是应该筛掉基因还是最大简约法画树。希望老师指导。谢谢!