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问题 做转录组分析建立索引时,出现如图的问题,看资料是mRNA和cDNA名称一样,问老师,老师发了一个连接,里面有一个 AWK命令,老师建议修改一下,自己按照理解,修改了一下,但一直未达到目标,想问一下老师,怎么修改!

问题 一个基因家族得到两个结构域的ID,然后把两个ID合并去除相同的ID,得到一个新的ID文件保存为fasta形式,传到pfam数据库中,得到一个文件,怎么筛选得到同时具有这两个保守结构域的ID。

问题 求教老师,我在做大麦基因家族分析构建进化树时,拟南芥中的已知的成员和我大麦中鉴定出的成员分不到一起,拟南芥单独分了一支,没办法做比较,这种情况怎么解决呀

因为这个家族只在拟南芥里鉴定过,只有18个成员,我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较

文章 百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go上传失败

... 解决方法: 在电脑浏览器登录 pan.baidu.com。按 F12 打开开发者工具,点击 Network (网络) 标签。刷新页面,点击任意一个请求(如 index.php 或 api 开头的请求)。在右侧 Request Headers (请求头) 中找到 Cookie 字段。复制整...

问题 请问三倍体重测序数据可否用于2n配子形成机制的研究

... 第二次分裂发生重组(he sccond divisionrestitution,SDR):指性母细胞第一次减数分裂正常,第二次减数分裂失败,形成二分体。该利方式形成的配子保留亲本33%~35%的杂合性。 母本是参考基因组,已发表。 若把父本和三倍体子代送样...

文章 3分钟学会画venn图(维恩图、韦恩图)

...即可,对应关系要记好: 二、在作图网站填入数据: 打开网站:https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/ 在输入部分黏贴刚刚准备好的数据: 这时你会发现在页面右侧,venn图已经做好了,我们再做些简单的调整就可以了: 当...

文章 Evolview:进化树设置标签的背景颜色

... data for leaf background colors,填写相关数据后提交。 命令格式说明 设置语句包括3列:location,color,commands,由制表符分隔。第三列可有可无。 l  第一列:可以是一个叶节点,或者由逗号分隔的2个叶节点 l  第二列:颜色的...

文章 基因家族进化分析 发10分文章

...在芽中显性表达,从而避免了竞争 。 基因复制与进化综述推荐阅读: 我们知道基因家族是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因复制或者加倍而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因,它们在结构和功能上具有明显的...

问题 老师您好,我看到您的文章里有批量修改序列ID的操作,那Figtree里批量改颜色请问一下需要怎么操作呢?不是所有的序列都需要改颜色。我模范您的方法修改颜色发现不行,不知道里面有什么细节需要注意?

问题 您好老师,我用get_gene_gff.pl提取的基因位置文件gene_chr.txt没有第一列基因ID,并且数量对不上,我只有一百多个基因,它提出了几千条信息,请问这种怎么处理呀?

问题 如何在Windows PowerShell基因组GFF文件中搜基因的个数呢?比如说在斑马鱼中搜索DMBT1基因,搜到了一个,想搜还有没有这个基因,如何搜下一个呢,怎么操作呢?需要输入什么指令呢?

问题 circos画完图后染色体id和基因名字重合了,该怎么修改配置文件呢?还有gff3文件是有HiC_scaffold_12.1这些,但是没有家族基因在这个上面,那circos需要把这块区域展示出来吗?

问题 老师你们好,想问一下如何在自己服务器上下载docker

现在一直在跟随组学大讲堂学习家族文章和BSA,但是都需要docker,看docker安装的课程,也没看到在服务器上具体安装,例如BSA中,mutplot这是一个软件吗?还是脚本?

问题 老师您好,请问一下在做WGCNA的时候,形状数据文件具体是哪种的呢,因为课程里的是直接给出来的形状文件做分析,看着有点摸不着头脑,想请问一下这个形状文件是怎么来的吗?我还不太理解这个文件

问题 请问我按照TCGA 生存分析教程做的森林图,发现与COX多因素的结果不一致。比如说mic-320b-1,在多因素中p0.05,HR值跨过了1。怎么理解森林图的结果与COX不一致?谢谢