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问题 请问如果我先对蓖麻,拟南芥等的CDPK基因家族做了blast分析,找出了蓖麻中的CDPK基因,还用进行那些hmmer分析什么的吗

问题 我的分析内容是16s分析肠道菌群,我是按照咱们课程里的步骤进行的,但是source env.sh 这个命令输入后出现这个界面,请问如何解决

问题 请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量

我有几个同浓度胁迫下的转录组数据,想利用此数据分析一下某基因家族,请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?

问题 基因组间共线性分析

做基因组间共线性分析时,/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors   ATH.rapa.anchors.new,过滤的命令中的30是什么意思,做单子叶植物和双子叶植物基因家族共线性分析时候,m...

问题 非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

老师,请问比如说我建了家蚕得KEGG和GO注释库之后,我的实验对象是家蚕,而是鳞翅目其他得虫子,那样得话 我有一个基因列表,但是要怎么进行富集分析呢?就是想问一下怎么利用近缘物种进行富集分析

问题 基因上游顺势作用原件分析

在进行基因上游顺势作用原件分析时,根据位置信息提取,promoter序列 1500,只能提取部分基因的序列,运行过程中遇到如下问题: 下面截图分别是基因在染色体上的位置信息以及基因组信息

问题 lncRNA和circRNA分析教程

老师您好,学习了您的RNA-seq教程感觉讲的非常好,并且资料丰富便于自学,请问有lncRNA和circRNA测序相关的分析教程吗?

问题 非模式生物的富集分析

老师,您在帖子上推荐的非模式生物的注释富集分析网址打开了,http://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterprofiler-maize/,这个网站打开,老师,还有其他办法没?

问题 转录组mfuzz分析问题

在mfuzz分析完后,通过ClusterGVis可视化,但是出现了图片中的报错,开始以为是自己数据格式有问题,我替换了课程资料提供的示例文件,也出现同样的报错内容,请问怎么解决?

文章 用Ai助手帮我写脚本

当我们想在linux下批量处理数据时,已有的脚本一定能达到我们想要处理的效果,这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说,一些生信脚本是非常晦涩难懂的,google百度得到的回答也时常连贯,很难顺利...

问题 二代测序数据可否用于基因家族分析

样本数据是二代测序得到的,请问二代测序结果可以用来做基因家族的分析嘛?准确性和全面性是否会受到质疑?

问题 请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

问题 泛基因家族分析核心基因的确定

我在根据直播课程学习泛基因家族分析。请问老师如何确定核心基因等。如玉米TPS家族鉴定的这篇文章。

问题 做基因家族分析时筛选出的基因氨基酸数量少

老师您好!我做基因家族分析时筛选出来的有些基因氨基酸数量少,这些基因是是要删除掉再进行后续分析呢?

问题 微生物16S测序策略和OTU/ASV分析策略

老师,您好!想请教您微生物16s测序,后续管是进行OTU分析还是ASV分析,前期的测序策略是是都是一样的,深度各方面都没有差异?谢谢老师。