问题 老师你好，我想问信息检索的问题，同样查询NBS蛋白序列，想用他俩的NBS序列与拟南芥的NBS序列做blastp。搜索页面出现的关键字不一样？他们有什么关系吗？我该怎么下载？谢谢老师。

问题 请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步，会出现提示说mRNA没有相对应的gene id 呢，可是文件中有gene id 呢，如图所示，而且输出的mRNAgeneID.txt里也没有转录本信息

问题 您好，请问您paircoil2安装问题解决了吗，我安装也出现了和您类似的问题，我也按照那个文件要求把配置文件放在家目录下，但是仍然命令使用不了，网上实在搜索不到相关信息，只能请问您了，望回复

问题 基因家族全基因组文件如何选择？条目太多，不知哪个是教学中讲解的protein.all文件/cds.all文件/cdna.all文件？还望老师讲解一下每个文件中具体包含的是哪些信息？衷心感谢！

https://genome.jgi.doe.gov/portal/Phyca11/Phyca11.download.ftp.html

文章 TCGA数据处理流程中各种组织机构介绍

...和小组的快速总览，要想对特定的小组或中心获得更多的信息，请单击相应的标签： 中心/小组描述TSS组织来源点，收集样本（组织，细胞，血液）和临床元数据，然后把这些数据和样本送到BCR。每一个组织来源点都有一个ID来...

问题 老师，用GSDS２.０把基因结构和保守基序绘在同一张图里（像下面那张图一样），“Gene Features （基因位置信息）”和“Other Features to Display (保守基序)”需要以什么样的格式输入呢？

文章 群体遗传进化分析用MEGA

...进行克隆，然后利用一代测序的方法获得这些克隆的序列信息，那么怎么对这些个体基因序列进行分析，并进行相关的群体遗传进化分析呢？MEGA能满足这一分析的绝大部需求。 MEGA是已经大家都比较了解的一个分子进化遗传分...

文章 vcf格式文件基础知识与编辑操作详解

...了所有样品基因组中所有位置变异（主要包括SNP和InDel）信息。后续几乎所有的分析内容都是基于此文件，比如进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分析等等。因此了解VCF文件格式及其记录结果的意义非常重要。VCF文件...

问题 老师好，请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的突变信息不一致啊，网上很多教程我看也有这个问题似乎，所以比如第一行核苷酸到底是什么突变成什么了呢？谢谢！

问题 gff文件包含gene,cds,exon,mRNA的信息，但gene 和mRNA名称相同，不利于建立基因组索引，如何使用AWK命令批量只在mRNA的ID后面＋.1？

例如：修改前 01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001; A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001;Parent=GB_A01G0001; A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB_A01G0001; 修改后： 01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001; A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001.1;Parent=GB_A01G0001; A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB...

文章 Vennerable绘图组别名称（标签）位置调整

...后者整合到绘图对象中，重新绘图 获取组别标签的位置信息： w <- compute.Venn(Venn(Sets=StemCell[1:2]), type ="squares")SetLabels=VennGetSetLabels(w)print(SetLabels) 信息如下： > print(SetLabels)  Label         x        y hjust  vjust1...

问题 您好老师，我用get_gene_gff.pl提取的基因位置文件gene_chr.txt没有第一列基因ID，并且数量对不上，我只有一百多个基因，它提出了几千条信息，请问这种怎么处理呀？

文章 远程服务器登录putty（云服务器，实验室服务器等）

...云服务器 获得之后我们可以得到服务器登录要用到的信息如下所示 IP地址：192.168.1.10 端口：22  （默认） 用户名：omicsclass 密码：******** 2.登录服务器方法： 远程登录linux服务器，可使用putty登录，官方网站：： https://ww...

文章 非肿瘤文章集锦

... 本文的临床意义在于：目前关于瘦型多囊卵巢综合征的信息很少，临床上瘦型多囊与日俱增！有必要对瘦型和肥胖型多囊卵巢综合征的基因表达谱进行系统研究和比较，以便对该综合征有更全面的认识。这项研究帮助为精瘦和...

文章 看懂变异记录结果文件（VCF）

...了所有样品基因组中所有位置变异（主要包括SNP和InDel）信息。后续几乎所有的分析内容都是基于此文件，比如进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分析等等。 因此了解VCF文件格式及其记录结果的意义非常重要。VCF文...