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文章 科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

...CorelDraw、AutoCAD等。 科研当中矢量图代表举例,利用各种数据绘制的图都可以输出矢量图: 更多科研作图SCI文章设置要求:https://www.omicsclass.com/article/330 微信扫码关注下方公众号,并在公众号窗口分别回复 photoshop 和 illustra...

文章 茶树在非生物胁迫下的转录响应

...,每组三个重复,进行RNA-seq。 RNA-seq基本结果 测序数据经过处理,共获得316,200 transcripts,213,699 unigenes,平均长度分别为758 bp和565 bp。 针对所有的unigenes进行注释分析,包括常见的Nr、Nt、GO、KOG、KEGG等数据库。其中GO和KEG...

文章 Bedtools的简单使用—文件格式转换

...验室开发的基因组算法工具集,可以对基因组广泛使用的数据格式如BAM、BED、GFF、VCF等进行交集、并集、计数及格式转变等操作。想更详细的了解Bedtools可参考官方教程:bedtools: a powerful toolset for genome arithmetic — bedtools 2.30.0 docum...

文章 AI保存PNG/PDF/JPG时“出现了未知错误”的解决办法

...选择:文字(SVG)、子集化(无)、图像位置(链接)、包含切片数据(不勾选),然后点击确定。 《4》如图:保存好以后,文件就变成了一个网页链接。 《5》然后双击网页链接,通过浏览器打开;再点击鼠标右键,选择打印;再...

文章 生化检测是什么?生化检测试剂盒该怎么选?

...和精力,同时,也大大节约了样本量,获得更可靠的实验数据。 与实验室常用的ELISA试剂盒对比发现,生化检测试剂盒有着不可替代的作用,可以和ELISA试剂盒互为补充。 生化检测试剂盒一般检测领域: 氧化与抗氧系列、谷...

文章 R包 CandiHap 进行单倍型分析

...为我们测序和测定结果,GFF基因结构注释文件可从基因组数据库下载。注释后的txt文件需使用ANNOVAR软件对vcf文件中SNP和INDEL进行注释得到。 R流程如下: perl  vcf2hmp.pl  test.vcf  test.si_multianno.txt  0.1 library(CandiHap)if (! require("eoffi...

文章 组学大讲堂周年庆特大优惠---VIP最高返礼6800元!!

组学研究中,数据看不懂、新人难上手、外包成本高,是不是让你头疼不已?别慌,组学大讲堂超级 VIP 来拯救你,助你一键破局! 点此处直达VIP详情页:VIP详情页 点此处联系客服了解详情:客服 省钱小能手,性价比爆棚...

问题 R脚本画相关性散点图时报错

...ales_add_defaults -> lapply -> FUN -> [ -> [.data.frame 我的数据为两列污染数据,类似: 已转为tsv格式 源代码如下: #!/usr/bin/Rscript #设置镜像 local({r<-getOption("repos")   r["CRAN"]<-"https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"    optio...

文章 kaks和dnds是什么?

...物种的进化有着非常重要的意义。我们可以根据Ka/Ks ratio筛选部分基因,然后做后期的功能研究,这种方法已经普遍的被应用到分子进化领域,已有多篇文章在Nature,Science等杂志发表。 除了查找快速进化基因,Ka/Ks还能检测基...

文章 R语言-Cox比例风险模型

...支持的方法有:exact,breslow以及exact,默认是exact 以lung数据集为例,看下性别因素对生存结局的影响 data("lung") res.cox <- coxph(Surv(time, status) ~ sex, data = lung) > summary(res.cox) Call: coxph(formula = Surv(time, status) ~ sex, data = lung) n= 228,...

问题 WGCNA中过滤低表达量(0.5)时datExpr0=datExpr0[1:n,datExpr0[n+1,] > meanFPKM]不成功,且变量从上步30769变成了0. ?

老师,您好,WGCNA分析中,过滤低表达量的数据中,运行代码如图,运行到datExpr0[n+1,]=apply(datExpr0[c(1:nrow(datExpr0)),],2,mean)一切正常,有30769个变量,但是datExpr0=datExpr0[1:n,datExpr0[n+1,] > meanFPKM]这步运行始终不成功,也不报错,变量...

文章 学霸总结:实时荧光定量PCR的结果分析

...,而且准确度高、效率高、重复性好,为实验提供可靠的数据。   如果你的科研时间有限,也可以选择巴菲尔实时荧光定量PCR检测服务,   巴菲尔拥有近10年的科研技术服务经历,在生物技术服务方面有着多年的经验积...

问题 GEO boxplot和密度分布图的绘制

...到上图结果,通过加入outline= F,可以纠正错误。 但是我数据整理后,进行密度分布图的时候, 出现上图的问题, 不是很熟悉ggplot2,不知道代码哪里进行修改。 P_density_GeneID = ggplot(datExp,aes(x=Exp))+geom_density(aes(fill=as.character(d...

文章 eclipse下搭建shell脚本编辑器--安装开发shell的eclipse插件shelled

...atest/download下载ShellEd的zip包 以archive,即zip包的方式设置数据源: 在shell文件上点右键->open with->选择shell script Editor,发现打开的SHELL的文件已经语法高亮: 有的eclipse默认是用eclipse自带的text editor打开shell文件的,安装了sh...

文章 perl或者python代码:批量修改进化树中基因ID或者物种ID名字 nwk文件

...用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通