...用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高
...花品种的管状花和舌状花进行转录组分析，获取基因表达数据并进行了主成分分析，结果显示在大多数品种中，心花和舌花的表达模式可以明显区分，但对于 F，心花和舌花样本呈现出更独立和不同的表达模式。 03.代谢组分...
...表型是显著关联的，我想保留indel位点，并在热图中与snp数据同时可视化，类似下图这样。请问应该怎么做，或者需要添加哪些参数？ ps:查看了https://github.com/bgi-shenzhen/ldblockshow上的LDBlockShow说明书里头没有提到有关indel的其他细...
请教一下，我在构建进化树的时候出现这个报错，是不是因为我整理数据的时候有重复的单个文件呀？遇到这种情况，我应该怎么处理呢？
转录组数据分析时，进行到read 与基因组比对时，产生的sam文件为空，summary文件信息为： Error reading _rstarts[] array: 1010748, 1017096Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)Command: /biosoft/hisat2-2.1.0/hisat2-align-s --wrapper basic-0 -p 1...
我在采用TCGAbiolinks下载TCGA数据时，出现了“Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later”的代码，然后按照社区里的解决方案运行了代码 结果一直报错，显示Error in utils::download.file(url, path, method = download_method()...
...ty_stat --name "${i}_Group_boxplot" done 我只有一个分组Group，元数据文件也没有问题
...GSEA排序； -g 指定 gmt文件 基因集： 更多GSEA功能富集数据下载：http://software.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp#msigdb 使用举例： #更多GSEA功能富集数据下载：http://software.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp#msigdbwget -c https://data.broadinsti...
.../ampliseq:v2.0 然后跑 ### 物种注释 16S/18S #全长作为分类数据库： qiime feature-classifier classify-sklearn \ --i-classifier $silva_classifier \ --i-reads ../02.feature_table/repset-seqs.qza \ --p-reads-per-batch 20 \ --p-n-jobs 20 \ --o-classification ta...
...snp? 样品污染可能导致重测序mapping rate 值较低的话，这种数据还可以进行gwas分析吗？发文编辑会不会质疑数据的可靠性？
如何获取基因功能参考数据，如何导入进行富集
...验室分析中最重要和最常见的误差来源，却常在分析实验数据时被忽略。 分析前因素包括生物性和非生物性因素： 生物性因素一般是固有的，例如品种，年龄，和性别，但在评估检测结果时需考虑，实验室提供的绝大多数的...
...课程简介：从Linux基础到reads比对基因组、call SNP等重测序数据处理，再到群体遗传进化和GWAS关联分析，主流分析内容一课尽揽。 课程价格：原价：4480元/人；限时优惠4080元/人。 团报优惠：2人及以上减200元/人。 参加本次培...
...写或值得分析的内容；RCSB（https://www.rcsb.org/）这个网站数据蛮全，能搜到相应的蛋白结构，但不知道有没有可以写的东西，有没有相应的参考文献呢？ 例如像这篇文章所呈现的 （备份）erz51112.pdf 谢谢老师！
...owcell当中；那么问题来了，这样丢掉了很多片段，我们的数据是不是不能覆盖所有的基因（RNA-seq）或者基因组（重测序）？ 这个不必担心，因为我们的文库DNA量足够的大（PCR扩增），测序的量也是过量的，只要这两个过程够随...