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文章 520又又又到了,为啥科研汪不容易找对象?

...年用培养基养出来的“心形”细胞元,后专业的显微镜下显示的皮鞘型的细胞元结构,后经专业人员的保存与制作,形成画展并装饰led等成为“含蓄派”科研人的表白方式, 这是工作上的精进也是爱的表达方式,也是告诉心爱...

问题 各位老师好,在做mcscanx共线性分析的时候,提取pep.fa的时候,pep.fa应该是输出文件,结果报错Could not read file 'pep.fa': No such file or directory

脚本内容如下 报错信息如下 如果创建了pep.fa的空白文件的话程序可以正常运行,但是文件没有输出结果。 希望各位老师能够答疑,小弟感激不尽!

文章 2020国自然热点预测:2019最火的7大方向解读!

...019最火的7大热点方向,有你吗? 纵观今年的国自然评审结果,非编码 RNA、m6A、外泌体、肿瘤免疫、细胞自噬、肠道菌群、干细胞等大方向属于科研热点。 热点一:非编码RNA 1,miRNA miRNA也算是老而弥坚的热点了,热度已经...

文章 扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

...发了不少高分文章,CNS级别文章中频频出现机器学习分析结果的展示,以下为分析原理及文献解读连接:《随机森林在微生物数据应用-文献讲解》、《 肠道微生物可用于诊断慢性肾病-随机森林分析(IF=15)》《 随机森林预测...

问题 (ERR): "--dta" does not exist Exiting now ...为什么hisat2有这个选项却报错

...data/${i}_2.fastq.gz \ -S ${i}.sam 2>${i}.summary  done 最后出现结果文档报错 (ERR): "--dta" does not exist Exiting now ... 请问怎么解决

文章 MutMap+和mutmap分析差异(BSA)

...换,得到Hitomebore的参考基因组,如果我们的突变型测序结果比对到Hitomebore参考基因组上,与参考基因组不同的碱基即为突变碱基。以下是作者原文: reference sequence was constructed by replacing nucleotides in Nipponbare with those of Hitomebore at...

文章 计算串联重复基因KaKs的时候,aln文件一定要通过脚本转换为axt文件么?这两种文件格式是否可以直接通过修改扩展名来实现?

...软件另存为你需要的文件格式,不过不能,例如序列比对结果的aln文件到计算KaKs的输入文件axt文件,这就需要通过程序软件来实现格式转化。

文章 tcga_gene_exp_download.r TCGA数据下载脚本使用说明。

...  使用命令示例: Rscript tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD 结果展示: 临床数据基因表达数据Counts基因表达数据TPM基因表达数据FPKM 注意:基因表达文件中的基因ID已经替换成gene symbol,重复的gene symbol 随机取一个作为代表; 样...

问题 TCGAbiolinks使用求助 Downloading genome information (try:0) Using: Human genes (GRCh38.p13) Error: $ operator is invalid for atomic vectors

...--------------- 按照前辈 给的代码删除数据重新跑了一遍,结果

问题 求教老师,我在做大麦基因家族分析构建进化树时,拟南芥中的已知的成员和我大麦中鉴定出的成员分不到一起,拟南芥单独分了一支,没办法做比较,这种情况怎么解决呀

因为这个家族只在拟南芥里鉴定过,只有18个成员,我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较

问题 老师,你好。在做有参转录组分析,转录本基因表达量出来之后,发现里面找不到我期待的同源基因(ID),不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID,问题是这些ID在我的注释文件里根本没有,详细情况如下

命令如上,产生其中一个(T01)结果如下:找不到我所期待的基因,这是什么原因呀

问题 采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时,用inner_distance.py报错。

...ributionNotFound(req) pkg_resources.DistributionNotFound: pysam 网上也搜索了报错信息,还是不明白,不知道怎么解决。

文章 Split划分数据

...11 hm24h18 GSM1626012 hm24h 按照第二列分类进行数据分组,由结果可知被划分成了六组数据 > com = split(dat,dat$group)> com$con12h Samples group4 GSM1625998 con12h5 GSM1625999 con12h6 GSM1626000 con12h$con24h Samples group7 GSM1626001 con24h8 GSM1626002 con...

文章 奇葩的导师太多?nature index一张图告诉你怎样选导师!

前不久Nature曾经发布过一个文章, 文章显示,在针对6300名博士的调查中, 有1/4的博士表示,如果再给一次机会,他们想重新选导师...... 有49%的博士表示:他们每周与导师面对面时间不到一小时,平均1天交流不到9分钟...... ...

文章 TCGA癌症和正常组织中的基因表达差异图

..."Tumor",'Normal')) p + stat_compare_means(comparisons = my_comparisons) 结果如下下图: 如果您想学习TCGA数据挖掘方法,可以学习我的课程: 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-转录因子调控》 《TCGA-ceRNA调控网络分析...