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问题 老师,请问物种间mcscanx绘图报错float division by zero怎么处理。(已经确定两个bed文件和染色体的ID一致对应的)

问题 老师您好。做GSEA分析图,我在上传文件 的时候。文件名是.gct。出现下图所示这样的错误,请问是什么原因呢?怎么处理?

问题 老师,我下载omicsclass/biolinux镜像,忘记在docker desktop上修改储存路径,,这个镜像有点大,按照文章推送的方法,好像不行,这个应该怎么去操作呢

问题 请问我在ncbi上下载了序列后(fasta文件),一点开就自动这样,然后好久也没结果,请问我该怎么办?谢谢大佬

问题 老师您好,我在做变异结果质控,过滤二vcftils.p1代码输入无误但是结果总是显示command not found ,生成文件为空是怎么回事?

问题 如何整理茶树的KEGG代谢物背景库

...te/htext=csin00001.keg&query=csin00010)上的数据转换成这样的格式,如何快速进行手工整理,请各位老师指点。

问题 GEOquery 下载不了数据

..."https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/%s/%s/matrix/%s",  :    无法打开URL'https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE66nnn/GSE66597/matrix/GSE66597_series_matrix.txt.gz' 此外: Warning message: In download.file(sprintf("https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/%s/%s/matrix/%s",  :   ...

问题 AWK整理泛基因集文件出现部分问题

您好,我在使用以下代码进行格式整理后发现,部分出错 awk -F"\t|-|_" '{print $1$2"\t"$3"_"$4}' 13Pan-genes.list > apple13.pan-genes.list 我的13Pan-genes.list文件如下 整理后的文件如下,有部分基因如Msi开头的没有加上第三列的信息

问题 做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤,我想问一下这个命令在写文章的时候怎么描述呢?

/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors ATH.rapa.anchors.new

文章 ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

...athway,PPI等一系列分析,在分析一下与生存的关系、免疫细胞丰度的区别,等等。找出了分之间免疫细胞有区别、生存有区别,一篇揭示XX癌免疫应答异质性的文章就来了。 Consensus Clustering 的基本原理假设:从原数据集不同的...

问题 使用tassel对vcf文件进行 -SortGenotypeFilePlugin 基因型排序时自动锅炉掉了我的两条contig,这个问题怎么解决呀?

我要做Gwas分析,需要生成hapmap文件,但是我直接用vcf转hapmap会报错Please first use SortGenotypeFilePlugin to correctly order the file.所以我就用tassel去排序然后可以正常生成hapmap文件了,但是我的两条比较小的contig不见了

问题 老师你好,最近我在使用tbtool的blast时发生报错

具体报错如上图,查询序列和subject序列均为FASTA格式,blast+也安装好并且配置了环境了

问题 TBtools怎么修改motif的填充颜色,点击了element group出现color picker界面,但里面没有可供颜色可以选择的,请问只是什么情况呢?

问题 TBtools怎么修改motif的填充颜色,点击了element group出现color picker界面,但里面没有可供颜色可以选择的,请问只是什么情况呢?

问题 老师 gff3文件第三列应该显示gene cds exon等符号处 没有gene符号 最后找到的文件也是空的 怎么