1.我的数据介绍: 我这做了 一个对照和处理各取了四个时期的样品进行转录组分析,每个样品3个生物学重复,共24个样品基因表达量数据; stage1stage2stage3stage4controlDAF2 DAF5DAF11DAF16caseGDAF2 GDAF5GDAF11GDAF16 以上是输入数据,CK...
...都只有一条序列,导致在做geneID这一步,运行“geneid -G -P ./output/${species}.geneid.optimized.param ../contig.split.hardmasked/seq${i}.fa > ${i}.out.gff”时,报错*** Error in `geneid': malloc(): memory corruption: 0x00000000024f61c0 *** ======= Backtrace: ========= /usr/...
...的拆解和分配。 三、将任务进行优先级安排 为了更好地把控项目的进程,让各个任务有序完成,应通过任务的重要度和紧急度来进行优先级的判断。按照轻重缓急进行事项上的安排,能让你更好地把控项目进度,让一切...
如果用0表示是否造假
拥有的转录组数据包括基因的NR注释,Swiss注释,Pfam注释,KEGG注释,GO注释等功能注释,也有基因的氨基酸序列,核苷酸序列,想知道有什么方法或者工具可以达到目的,谢谢。
行转列样例文件如下 cat file.txt a b c d e f g h i 1、cat file.txt |xargs -n1 2、xargs -n 1 < file.txt 3、tr " " "\n" < file.txt 4、sed 's/ /\n/g' file.txt 此命令在Linux上执行正常,在Mac上执行无效,原因是因为Mac上的sed是BSD版本,Linu...
vcftools可以随机抽取指定个样品的vcf文件,用到的选项为 --max-indv ,指定要从vcf文件中随机抽取指定个样品。 具体用法如下: 下图为原始vcf文件。 随机抽取5个样品,执行以下代码: vcftools --vcf snp.vcf --max-indv 5 ...
...fGene -operation g -nastring .,第一次结果输出虽然有VCF和txt两个文件,但是发现并没有把染色体注释完全,有好几条染色体没有结果。第二次运行发现,输出文件有个无效的:snp.refGene.invalid_input,并没有输出vcf文件,以及输出的注...
安装docker时有个步骤需要“以管理员身份运行”,但是我的电脑上没有这个选项是什么情况?