我按照课件上的内容进行Blast分析串联重复基因,没有筛选得到串联重复基因。把比对的结果导出来后,找到我的基因家族的基因全长,通过计算发现相对于较长基因的比对率都很低,然后发现我的cds文件并不是基因的CDS,而是m...
...研究的细胞和组织类型以及实验要求,从多种内参基因中筛选出适合自己实验的稳定表达的内参基因,同时也可以选择多内参基因的研究方法,设置两个或两个以上的内参基因,取均值后校正目的基因,从而得到更可靠的结果。...
seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除
比较两组不同数据时,每组分别设置了四个生物学重复,那么比较这两组数据的差异蛋白时应该怎么把这些生物学重复的数据归一呢?还是要对其中的每一对生物学重复组分别进行比较?
... FDRgene1 1 0.001gene2 -1 0.001gene3 1 0.001gene4 2 0.0001 筛选条件:log2fc的绝对值大于1,FDR<0.05 命令: awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{if(FNR==1) print $0; else {abs_log2fc=($2<0?$2*(-1):$2);if(abs_log2fc>=1 && $3<0.05) print $0;}}' de_gene.txt $2代...
老师您好。我最近想要筛选出两个种群(亚种)之间存在保守差异的基因,以此从基因层面快速鉴定两个种群。请问有什么方法可以做到?或者有哪些课程的内容涉及这部分?谢谢!两个种群的全基因组都测了。
我现在正在从事研究的物种基因组组装只到scaffold,没有染色体水平,请问这种情况下能否进行串联重复基因筛选及其圈图的绘制
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pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*Hyper-V*.mum >hyper-v.txtfor /f %%i in ('findstr /i . hyper-v.txt 2^>nul') do dism /online /norestart /add-package:"%SystemRoot%\servicing\Packages\%%i"del hyper-v.txtDism /online /enable-feature /featurename:Microsoft-Hyper-V-All /LimitAc...
...,需要让compound与注释结果成一对一的形式,这个应该咋筛选?我知道的方法是按score值选取数值最大的注释结果,但是score值也有多个相同的,您看这个表 另外想请问各位老师,做进一步的代谢物通路富集一定需要确定代谢物...
bed文件为空白,是否说明在规定阈值下,无有效位点。 glm_pvalue.txt pvalue.bed文件空白