问题 python版本的MCScanX绘图（比较基因组学）

如图所示，我在做比较基因组学python版本的MCSanX绘图最后一步根据配置文件出图时显示这样的错误提示，这是为什么呢，我检查了一下我的文件格式什么的都没有错，命令也没有输错。请老师指点一下。

问题 为什么蜈蚣图画出来是这样样子？我的配置文件感觉没有问题。

只有两条染色体是正常的。 配置文件每条染色体内容格式一样。

问题 老师好，我有个基因和小RNA的互作图要整理，其中要在图上格外标注出所在的通路，在cysocape应该怎么操作

模仿这个做一个类似的。我是找了15条代谢通路

问题 HiC-Pro使用

请问老师，我已经成功安装了HiC-Pro, -h会有帮助信息出来，但是运行HiC-Pro -c config-hicpro.txt -i rawdata/ -o results，缺没有任何提示自动停止了，生成了仅包含链接的rawdata和config文件的结果文件夹，请问应该如何成功运行这个软件

问题 蛋白3D结构预测

...用氨基酸序列通过swiss-model得到模型。然后在通过第三方软件看评分就可以了。

问题 你好，我想问一下，我想从大的vcf文件里面提取出我想要的多个个体，我要怎么操作呢?搞了好久没搞明白

这是我的命令：vcftools --vcf buffalo.vcf --keep keepInds.txt --out mybuffalo.vcf

文章 perl语言USAGE 标记

...开始，直到遇见“USAGE”为止，所有的字符都按照指定的格式存入变量usage中。你可以用EEE，MAMA等等其他的名字都可以，就是一个标记而已，它的作用就是简化输入。

问题 我在文献中读到这么一段话，是关于某一基因家族在某植物各个组织器官中表达的，请老师帮我看看这是怎么做的

...是描述做植物各个组织器官各基因的表达量的，请问这是怎么做的？

问题 如何在linux服务器上安装paircoil2

...r.gz安装包，然后上传到服务器上并解压后， 如图所示，怎么安装运行paircoil2？ 我看README中说是如下这样安装 请问这是什么意思，怎么安装呢，怎么放到家目录下之类的？ 新补充细节：直接运行结果如下，说是没有配...

问题 安装clusterProfiler时，按照正常source("http://bioconductor.org/biocLite.R")，biocLite("clusterProfiler")，结果出现下面问题是怎么回事呢？请老师帮忙解答，谢谢！

问题 老师，我用的拟南芥示例文件，完全按照老师讲解的步骤，但是在新构建.hmm文件后，再用hmmsearch搜索家族成员时报错是怎么回事？

问题 请问一下用circos画基因组共线性图时，genome.blocklink.txt这个文件是怎么来的呀（和MADS.link.txt一样吗）？

问题 mapman里边如何确定要研究的通路？例如我想看内质网中的蛋白质加工，但是mapman里边没有，这要怎么办？？？？蟹蟹

问题 mapman里边如何确定要研究的通路？例如我想看内质网中的蛋白质加工，但是mapman里边没有，这要怎么办？？？？蟹蟹

问题 使用基因家族特异的隐马尔科夫模型筛选过蛋白质组库以后，发现含有该保守结构域的片段太多怎么办