...择，使项目与组织业务目标一致；一方面通过自下而上的数据归集，为管理者分析和决策提供客观实时数据支持。 CORNERSTONE基石协作是一个一站式项目管理协作平台 结合应用了 销售管理 运营管理 产品&am...
...用引号引起来："Stage IA" --fdr 0.05 --fc 2 设置差异基因的筛选条件：显著性和差异倍数（默认fdr=0.05，fold change=2） 使用举例： $$Rscript DEG_limma.R -e TCGA-ESCA_gene_expression_Counts.tsv \ > --fdr 0.05 --fc 2 -m metadata.group.tsv -t subtype.hclust ...
...含要进行相关性分析的两个变量，且两个变量需为数值型数据，如下列表格所示： barcodeHRDIRPSTCGA-A1-A0SB-01A-11R-A144-07013.47TCGA-A1-A0SD-01A-11R-A115-072520.22TCGA-A1-A0SE-01A-11R-A084-071519.54 更多脚本参数设置及说明 初次使用脚本时，可以通...
在学习比较基因组课程中，我使用从葫芦库基因组数据库中下载的genome.fa,cds.fa,pep.fa,gff文件运行01.prepare_data.sh脚本时可以正常的获得gff文件，但是在提取cds和ped时，出现报错 报错如下
...的对照样品比较计算后可以获得DNA的倍性关系。 2. 测序数据分析 Smudgeplot： 从k-mer数据库中提取杂合k-mer对，然后训练这些杂合k-mer对。通过比较k-mer对覆盖度的总数CovA+CovB和相对覆盖度CovB/(CovA + CovB)统计杂合k-mers对的数量，解...
您好，我看了您发布的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的文章，另外我在github 上也看了isoseq3的流程，发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。不过虽然github上有这个步骤，但是isoseq3 中并没有refine 这个工具（...
例如这样的数据 GSVIVG01025691001 GSVIVG01026145001 GSVIVG01014236001 GSVIVG01021397001
...sembly文件，我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对，但是verkko的组装结果文件里似乎没有这个文件？
我做的核桃，数据是按无参基因组分析的，以拟南芥为参考基因组。现在核桃的基因组也已经公布了。请问，我应该怎么分析我的miRNA的启动子呢？
我用的RNA-seq的数据，并且也用hisat2建立索引了 但是比对的时候总是报错
...以下代码跑出来报错 ### 物种注释 16S/18S #全长作为分类数据库： qiime feature-classifier classify-sklearn \ --i-classifier $silva_classifier \ --i-reads ../02.feature_table/repset-seqs.qza \ #--p-reads-per-batch 100 \ --p-n-jobs 30 \ --o-classification ...
R语言在读取数据 例如read.table 添加check.names=F 参数可以保证数据种特殊的字符正常读取： 如数据表头 “-”被认为是“." > A=read.table("F:/test/WGCNA/data/fpkm/All.DEG_final_3000.xls",sep="\t",check.names=T,header=T)> head(A,2) ID ...
老师，请问用自己的数据，前面处理都没有问题，运行filter部分前还是'data.frame': 15 obs. of 24897 variables，运行给的filter部分代码后，总是显示0 variables，请问该怎么解决呢？谢谢
老师您好，我在进行GTDB注释时，根据课程所给的代码下载了GTDB的数据库信息，但进行注释时，却出现了缺少参考基因组的信息，具体情况见下图。请问该如何解决？
随着数据分析在科研工作中重要性的逐步提升，越来越多的老师、同学投入到生物信息学习的浪潮中来。 可生物信息学是门综合学科，很多生物出身的人在计算机软件使用、统计学等方面基础十分薄弱，方法上也经常找不对...