问题 请问在进化树+基因结构+motif+domain的四联图中，为什么domain结构在tbtools上显示不出来？？以下是我设置的domain文件，请看看有何不妥？谢谢

问题 看了perl 语言高级编程课后，对这句脚本不理解my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}";请帮忙解释一下，谢谢，特别是这句\\1{".($motiflen/$j-1)."}

问题 您好，我想请教一下如果是十个样品分别用不同TMT标记然后混合只进了一针质谱应该怎么用MaxQuant搜库呢，我搜出来的感觉不太对，谢谢您。

问题 在基因家族筛过程CD-searcch结果中如果显示结构域N端C端或者NC端不完整，这个序列还能留做某一基因家族成员吗

问题 基因组注释：10.PASA_update，根据fa和gff文件生成pep或者cdna

基因组注释：10.PASA_update，根据fa和gff文件生成pep或者cdna文件，一直显示： No such file or directory at /share/work/biosofTransDecoder/TransDecoder-v5.5.0/util/../PerlLib/GFF3_utils2.pm line 37, <$filehandle> line 112.

文章 快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

... . 示例数据 1. 进化树数据 abunt-tree.nwk： ((OTU_47:0.101892516,OTU_46:0.205918075)0.999:0.12637554249999997,((OTU_7:0.079452354,(OTU_9:0.03389913,OTU_35:0.011411273)0.857:0.016187755)0.936:0.055036757,(((OTU_10:0.178702248,(OTU_27:0.105807393,(OTU_21:0.021742283,OTU_23:0.036247052)1.0...

问题 MEGACC输入的数据应该是比对后的等长度的序列，在megacc里面有-f这个参数是进行序列比对的。。。但我的操作一直错误。。那位大神知道要怎么设置参数不？

问题 用bwa 进行比对时，用的是重测序的去了接头的clean data 吧，只需要参考基因组的全基因序列吧，不需要gff注释 文件之类的吧！

问题 利用FileZIlla上传转录组数据到GEO，为什么用电脑默认的ip地址没问题，用NCBI提供的主机名、账号就连接不上服务器，哪位大神可以指点一下

问题 MCSCANX和KAKS计算出的共线性对数目不一致，虽然用的都是70%同源性。这合理吗？如果用KAKS计算出的基因对做circos圈图合理吗？

问题 老师好，R包一直安装失败不知道怎么回事，Bioconductor上的安装出现问题，如图所示（但是加载的话不报错！），还有就是VIP还是没通过呀，我子订单也提交了

问题 老师，我在提取gene_exon_info.gff文件提取时运行正常，但是提取的结果不完整是为什么？有200多个基因但只提取出来几十个基因的信息

问题 我在call snp,使用GATK导入db,得到的结果中没有callset.json文件，我一共15条染色体，db文件夹里只有两个染色体的文件夹内容，麻烦老师解答

...hrB1 -L chrA1 -L chrA4 -L chrA7 -L chrB7 -L chrA2 -L chrB2 -L chrA3 -L chrA5 -L chrB5 -L ScaffoldUN -L chrA6 -L chrB4 -L chrB3 --tmp-dir $tmpdir  -R $REF --batch-size 5 \ --reader-threads 5 --max-num-intervals-to-import-in-parallel 5 \ --genomicsdb-workspace-path db --sample-name-map cohort.sampl...

文章 BWA比对及Samtools提取mapped reads

...ag1和flag2配对的序列分别输出到-1-2指定的文件，对于无法匹配的flag 1/2，全部的flag 0都会保存到-s指定的文件中。 ${ samtools} fastq -n \-1 R1.fq.gz \-2 R2.fq.gz \-s unmapped_singleton.fq.gz \sample_mapped.bam 参考链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/5140942...

问题 请问大家怎么找相关包或工具的原始文献？比如我要找edger包、Tagetsscan、kegg、go等的文献出处。通过百度可以找到一些相关的文献，但不确定，所以咨询下各位老师！