文章 SNP检测Massarray法怎么样？中高通量大样本适用吗？

...换等。 SNP作为第三代遗传标记，分布非常广泛，在遗传分析，疾病诊治，分子育种和种群生态评估等诸多领域有十分重要的意义。 进行SNP检测的方法有很多，如直接测序法、taqman探针法、massarray法、芯片法、高分辨率熔解曲...

问题 老师，在鉴定基因家族成员时，不同物种中已鉴定的此基因家族所用的pfam号是个不相同的，我应该怎么选呢，还是一般都可以用

问题 老师我想问一下，在鉴定基因家族成员时，可以有什么方法知道成员大概有多少个吗？还是我们自己不知道，但是发文章的时候审稿人知道

问题 老师，我这儿在Linux系统上安装了一个aspera的软件，然后我设置添加环境变量一直不成功呢，一直出现下图这种情形呢，老师您看如何解决呢？

问题 老师您好我用咱们线下课程的代码做WGCNA，和样品数据相比，我自己的数据在第一步输出的结果都不一样。麻烦老师帮忙解答一下

问题 老师，我看课程里有这一步，但没讲解后面的C是干什么的，也看不太清C前面上角那个符号是打的啥怎么打上去的

问题 保留蛋白质编码基因找不到gff文件，但是我是指定了路径的，而且ll也能找到这个文件，这个文件ee查看也看不出来问题

文章 一条命令筛选基因组指定区域内的所有基因

...k '$1 == "1" && $3 == "gene" && $4 >= 10000 && $5 <= 200000 {print $0} ' Arabidopsis_thaliana.TAIR10.31.gff3 > out.gff 命令会搜索 1 号染色体上10000到20000之间的所有基因。 其中 $1 == "1"  指定染色体，只需修改引号内染色体ID即...

问题 自己LDdelay时，绘制不出图且ld.bin.gz和ld.stat.gz文件大小只有1kb，请问问题出在哪里？

利用《群体遗传进化课程》提供的原始数据，步骤如PCA，structure等都能重复出结果，但LDdelay绘图时，出不了图。 教程中此步本应该输出更多文件，包括LD绘制图，但是实际只输出了以上3个文件。

问题 老师，构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch（e-20）搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么，不进行这一步可不可以

老师，构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch（e-20）搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么，不进行这一步可不可以

问题 cafe5#基因家族总数#这一步报错

...rity> export QT_QPA_PLATFORM="offscreen" Singularity> python3 ./cafe5_plot.py --nwk cafe_result3/cafe5_ready.nwk --clade_results  cafe_result3/Gamma_clade_results.txt --gfn $GFnum -d cafe_result3 QStandardPaths: error creating runtime directory '/run/user/1037' (Read-only file system)

问题 老师怎么样修改软件自动生成的baseml/codeml配置文件，怎么样手动运行baseml/codeml命令

...V,程序利用多序列比对数据调用baseml/codeml命令对数据进行分析，生成out.BV文件。由于mcmctree调用baseml/codeml进行估算的参数设置可能不太好（特别时对蛋白序列进行估算时），推荐自己修改软件自动生成的baseml/codeml配置文件，然...

问题 发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的domain、cdd的domain的位置不一样，有长有短，怎么办

问题 老师，第二次搜索结构域我们提取的结构域序列与最终三大数据库确定基因后提取的最终基因的结构域序列不一样是不是意味着错误

问题 海涛 海涛 运行时没有报错，pairid也是和demo里的内容一样，我没上直播，但是回放里学员也是做不出来，出来的.axt文件是空的