文章 R包更新网站

...踪R包的更新进展或者新发布的R包，及时进行本地安装或版本迭代，可以参考下方链接，依据时间显示R包情况： http://lib.stat.cmu.edu/R/CRAN/web/packages/available_packages_by_date.html 或者可以通过名称显示目前有效的R包： http://lib.stat.cm...

文章 Bowtie2使用方法与参数详细介绍

...--solexa-quals将Solexa的碱基质量转换为Phred。在老的GAPipeline版本中得以运用。Default: off. --int-quals输入文件中的碱基质量为用“”分隔的数值，而不是ASCII码。比如40 4030 40...。Default: off. –end-to-end模式下的预设参数--very-fast Same as: -...

文章 群体遗传进化名词解释

...构+motif—1张图全显示| 基因组间共线性图 | 多方法、多版本的微生物网络图绘制课程 | 热图竟然还能用Excel来画 | Cytoscape-网络图绘图技巧 | 怎么做一张好看的分类学树状图 |

文章 方差分解分析（Variance Partitioning Analysis）

... RDA 的变差分解 注：如果 varpart() 不支持 CCA，请更新 R 版本（如 R3.6 的 vegan） 分成两组（DOC 为一组，AP 和 AK为另一组）环境变量 cca_vp <- varpart(otu, env['DOC'], env[c('AP', 'AK')], chisquare = TRUE) 扩增子分析视频课程推荐：https:/...

文章 java 安装以及环境变量配置

...会报错，因此推荐下载JDK8： 注意windows x86为32位，x64为64版本，注意和自己的操作系统匹配。 https://www.oracle.com/java/technologies/downloads/ 查看自己操作系统是32还是64： 安装很简单，一直下一步就好了；记住自己的安装路径，...

问题 老师你好，请问从NCBI上下载的数据格式是.1，怎么转换格式，为什么我用Linux的wget命令下载下来的数据是这种格式

问题 请问我在ncbi上下载了序列后（fasta文件），一点开就自动这样，然后好久也没结果，请问我该怎么办？谢谢大佬

问题 要进行单倍型分析，但是镜像不是搭建在2.0版本了，docker pull下载不了，联系客服拿到安装包之后一直报错，解决了一天了也没解决问题，求解求帮助

问题 平台注释文件里没有Gene Symbol 怎么做GSEA分析？

从GEO上下载的芯片，进行差异分析之后，再进行GSEA分析，但是芯片的注释文件中没有Gene Symbol，请问该怎么办？

话题 匹配

话题 完全匹配探针

话题 非贪婪匹配

文章 热图竟然还能用Excel来画？

数据分析处理的过程中，绝大部分的科研工作者，都会存在利用数据绘制热图的需求。如果你会编程，利用R、MATLAB 等，完成热图的绘制轻轻松松没烦恼，其次你还可以利用热图绘制软件完成目标，但是你知道怎么利用Excel画热...

问题 黄老师，能不能在虚拟机上安装一个linux版本的paircoil2，我们用虚拟机好像自己安装不了？然后因为电脑版本较低也没法用cocker

我把文件解压缩了，但是没法运行，如下图，所以不知怎么运行 安装说明中提示要把配置文件.paircoil2放到home dictory 里面，这个文件在哪里，怎么放不知道

问题 老师，您好，请问知道登录号的情况下，怎么在EMBL数据库里下载全基因组的表达数据，我想从中提基因家族的表达数据做热图