文章 《Science》：中国人诚信全球倒数第一？这个实验设计科学吗？

...实验数据，价值真的不是很高， 借助实验数据的手段，分析“诚信”这类道德判断方面的问题，算不上什么高明的方法， 并且，作为发表在《science》这样顶级学术期刊上的文章，用“honesty”这种字眼和明显带排名性质的统计...

文章 eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error

...ITHOUT": syntax error""" 解决办法，是centos7 系统中的sqlite 版本太低，需要单独安装sqlite3，并添加到环境变量中 I found solution for CentOS7 users.Because CentOS7 users should install sqlite(>=3.8.2) from source, CentOS7 users need to set export PATH=/share/w...

文章 层次聚类方法详解

聚类算法综述 聚类分析（clustering analysis）是将一组对象根据其特征分成不同的 cluster，使得同一 cluster 内的对象在某种意义上比不同的 cluster 之间的对象更为相似。 由于 “cluster” 没有一个明确的定义，因而会有基于不同...

问题 fst_pi_select_sweep.r软件不可用

[root@eff2c0ebb6b8  08:44:02 /work/3.map/vcf]# fst_pi_select_sweep.r --fst F-G.fst  --pi1 FS_F.pi --pi2 FS_G.pi --zscore --log2 -A FS_F -B FS_G -c 0.05 -n fst-pi.F-vs-G  -f pdf bash: /work/3.map/scripts/fst_pi_select_sweep.r: /biosoft/miniconda/bin/Rscript: bad interpreter: No such file or direc...

问题 在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时，对不能用转录组数据比对回去的基因进行PCR验证，因为我不是学生物的，对PCR不了解，想问一下它是对那段基因的DNA进行扩增的吗？那段DNA是可以根据预测的序列人工制造出来吗？PCR扩增什么时候可以扩增出来什么时候扩增不出来呢？怎么就能验证基因的是否真的存在呢？

问题 在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时，对不能用转录组数据比对回去的基因进行PCR验证，因为我不是学生物的，对PCR不了解，想问一下它是对那段基因的DNA进行扩增的吗？那段DNA是可以根据预测的序列人工制造出来吗？PCR扩增什么时候可以扩增出来什么时候扩增不出来呢？怎么就能验证基因的是否真的存在呢？

问题 老师，下图是我的gff，文件，看着和您在视频讲的不一样，是不是需要转化一下格式，或者修改一下脚本？

问题 请问一下老师 学长让我在五条序列里挑一条结构域完整的 我不清楚怎么操作判断 可以指点一下嘛

问题 老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文件中删除这几个品种的数据

文章 很大的压缩文件计算行数

... std::endl; return 0; } 这需要一个需要支持C++11或更高版本的编译器，比如我是gcc-v12.2，编译命令为g++ -std=c++11 -o gz_rownum gz_rownum.cpp -lz -pthread编译的脚本还有个好处，丢你的环境目录里，在哪都可以直接运行，执行一下看看效...

问题 老师你好。请问共享目录挂载不成功，重装也一样，而且vbox屏幕不能全屏，no such device

图二为导入贵公司的linux后，打开设置的共享文件夹时，预置的两个共享文件夹。但在电脑中没有查询到，我就把它删了。重新创建了共享文件夹。不删而启动Linux将出现图三

问题 16S 差异比较使用compare_errorbar.r的时候报错

我用这个代码是他的前一步不报错，但是这一步报错，代表我的分组信息这些都是准确的 这个代码不报错 for i in {2..6};do     Rscript $scriptdir/meta_stat.r -i ../05.export_data/taxa_summary/absolute_abundance/feature_table_tax_L$i.txt \ -m $metadata -...

问题 老师，我在用TBtools做共线性的时候orange_NAC_genePos.tab.txt这个文件不合适，该咋解决

这是orange_NAC_genePos.tab.tx文件

问题 基因家族鉴定

这次用默认的参数跑到蛋白序列比对，发现有很多不全和缺失的，如图，比如第一条就没有锌指结构，返回查看原始序列都是没有的，准备删掉，后面几条也是连WRKYGQK结构都不全，也准备删掉，但是前面在数据库查看的时候为...

问题 老师，请问您们一下，我有使用McScan的经验，但是McScanX的是由方法有些地方不是很懂？

$$ blastall -i query_file -d database –p blastp –e 1e-10 –b 5 –v 5 –m 8 –o xyz.blast 是什么意思呢？