我做转录组测序，结果中有2个基因序列，它们在NR库中得到了相同的注释（gb编码相同），在Swissprot中得到的注释却不同。能解释一下数据库比对的原理吗？为什么会出现这种现象？
...了分析这些内容，关键的是该软件还能够绘制比较漂亮的结果图片。
...都应遵循同一个命名规则，这样易于排查样品及理解数据结果。4. 不要有特殊字符由于生信分析系统和程序的要求，样品名称中不能有汉字，只能包含字母、数字和“-”，且不能以数字开头，名字长度不能超过8个字符；名称中...
... 都这么惨了，买个车票去远处散散心，远离互联网吧？ 结果你发现 12306 你也上不去，他们的一大半系统靠阿里云支撑，要是没了阿里，他们估计连日常流量都要支撑不住。。。 既然听起来这么危险，干嘛还要用云服务器呢...
...odeml配置文件，然后再手动运行baseml/codeml命令，再整合其结果文件为out.BV文件。 clock = 2 * 设置分子钟算法，1: global clock，表示所有分支进化速率一致; 2: independent rates，各分支的进化速率独立且进化速率的对...
...目录中如果包含子目录，可以通过"-maxdepth"参数设置最大搜索目录深度，例如在当前文件夹下二级目录中也存在txt文件： 设置"-maxdepth 1"，仅获取一级目录下的txt文件 find ./ -maxdepth 1 -name "*txt"
从pfam找到基因家族的HMM模型，搜索物种的蛋白质数据库，得到了10个该基因家族的基因， 但是拿到ncbi和pfam去做蛋白质结构域检测，发现，这10个基因的结构域除了都只含有同一个结构域，没有包含其他的结构域了，这正常吗？...
...uster 提供可视化工具，帮助研究人员解释小RNA测序实验的结果。这可以包括集群图和其他数据的图形表示。 兼容性： SeqCluster 通常与常见的小RNA测序数据格式兼容，因此适用于各种测序平台生成的数据。 conda安装seqcluster软件...
...所以对软件的要求也非常的高。 TargetScan TargetScan是通过搜索和每条miRNA种子区域匹配的保守的8mer和7mer位点来预测靶基因。 http://www.targetscan.org/miRandamiRanda是John等于2003年5月开发的第一个miRNA靶基因预测软件。miRanda适用范围广...
...组，反向匹配使用grep (!/EXPR/,@array) 若使用标量接收返回结果，返回值为匹配的次数，使用数组接收，则返回值为匹配到的数组元素。 使用示例，使用grep函数判断数组中是否含有某个元素： if(grep{$_ eq $gene_id}@array) { ...
...关系数热图 geom_mark(sep = '\n', size = 2.5, sig.thres = 0.05) + #显示 Spearman 相关系数和显著性 geom_couple(aes(color = pd, size = rd), data = mantel, curvature = nice_curvature()) + #环境和微生物的相关性展示为上述 Mantel 相关 scale_fill_gradientn(colors = ...
...据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分...
....nih.gov:/blast/db/FASTA/nr.gz ./ sra数据库可以利用ascp ENA网站搜索下载： ENA主页ENA搜索SRR号，SRR9169172 命令： /share/work/biosoft/aspera/latest/cli/bin/ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR916/002/SR...
但是在导出Original Tree时就可以选择，而且我在忽略Branch_lengths选项导出nwk文件时，发现树的结果与生成的树有变化，想请教老师如何设置我可以选择Branch_lengths选项，bootstrap=1000，画树时的每一步设置都与课程中的操作一样
老师就是在比对结果过滤这里 ，mboI 和dnpⅱ两种酶都是GATC 我用mbol 这种酶能正常完成三步的过滤，但是我用第二种酶就只能完成上面的第一步，不能生成sample.bwa_aln.REduced.paired_only.bam这个文件，但是我问公司 ，公司说用的是...