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文章 2019基因编辑最新进展，CRISPR/Cas9还有优势吗？

...善的实验设备、专业的研发和技术服务团队; 　　●实验结果真实可靠， 留存原始数据，提供详尽的结果统计分析和解读; 　　●客户遍布全国20余省， 涉及各大高校，医院和科研机构; 　　●一对一的技术支持和项目负责人...

问题 reads 与基因组进行比对map

...qc/SRR1107723_1.clean.fq.gz -S SRR1107723_1.sam 2>SRR1107723_1.summary 结果中只有SRR1107723_1.summary，打开SRR1107723_1.summary，内容最后两行为：Error: Must specify at least one read input with -U/-1/-2/--sra-acc (ERR): hisat2-align exited with value 1 附件：SRR1107723_1.su...

文章 immune_infiltrates_rnaseq.r RNA-seq 转录组数据免疫侵润分析

...计算需要，可以指定类型，如果不指定 不输出TIMER的分析结果： # "kich" "blca" "brca" "cesc" "gbm"  "hnsc" "kirp" "lgg"  "lihc" "luad" # "lusc" "prad" "sarc" "pcpg" "paad" "tgct" "ucec" "ov"   "skcm" "dlbc" # "kirc" "acc"  "meso" "thca" "uvm"  "ucs"  "thym" "esca" "st...

问题 pheatmap绘制热图在添加聚类颜色标注的时候出现错误

...t = cellheight,border_color = "black") 其中head(mat)返回为: 绘图结果为 然后开始添加annotation,开始报错, 代码为: annotation_col<-read.table("/Users/aiyi/Downloads/annotation_col.csv",header = T,row.names = 1,sep=',') ==============================================...

问题 共线性分析之前提取的蛋白质序列为空。如何解决？

... allmRNAID.txt ../Phaeodactylum_tricornutum.ASM15095v2.pep.all.fa pep.fa。结果所得文件内容为空。查看pep.all.fa文件，里面的蛋白质序列后缀是.p1，而非allmRNAID.txt中转录本序列的后缀.t1. 请教老师，这个时候，我该如何使它们的ID一致呢？将pep.a...

问题 qRT-PCR 验证 RNA-seq 数据，材料必须是同一批处理的吗？

...您好：请问一个问题，就是用qRT-PCR 来验证RNA-seq 数据的结果时，做qRT-PCR用的材料必须和做RNA-seq测序时用的材料是同一批处理的吗？能不能后面qRT-PCR的材料是后面补做的，但是是相同处理的？我知道最合理的做法肯定是同一批...

文章 组学大讲堂 高效率提问指南！

...应过于宽泛： 反面教材：“如何学好生信”，“转录组结果怎么看”，这种三天三夜讲不完的问题，恐怕没人敢出手； 正面典型：“进行差异基因筛选时通常采用什么标准？”，“想对水稻根际土做16S测序，取样时应该注意...

问题 老师怎么样修改软件自动生成的baseml/codeml配置文件，怎么样手动运行baseml/codeml命令

...odeml配置文件，然后再手动运行baseml/codeml命令，再整合其结果文件为out.BV文件。

文章 蛋白结构预测

...步骤来预测蛋白质结构： 线程: I-TASSER首先使用线程技术搜索已知蛋白质结构的数据库，找到与目标蛋白质序列相似的模板。这一步是基于蛋白质结构更为保守的原理。结构装配: 使用模板匹配的片段构建蛋白质的初步三维结构...

文章 【前沿研究】肺癌转移机制的新靶点-- lncRNA AC026904.1

...然后，研究者研究了AC026904.1是否受TGF-β/Smad信号的调控。结果表明，TGF-β受体激酶的特异性抑制剂的预处理对TGFβ诱导的AC026904.1上调没有影响，这表明AC026904.1不是TGFβ/Smad信号的下游效应器。为了进一步确定TGF-β提高AC026904.1表达...

文章 癌细胞的十大特征

...细胞凋亡的主要方法是通过基因突变使p53蛋白失活。统计显示大约超过50%的人类癌症中发现p53蛋白的失活。 其四：具有无限的复制潜力 在细胞体外培养实验中，人们观察到，大多数正常细胞仅有60次左右的分裂能力。科学家已...

文章 肿瘤的TNM分期讲解（stage）

...据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分...

文章 简单科普：2019诺贝尔生理学或医学奖为啥颁给“细胞感受氧气”？

..., because you declare victory and get lazy.” ——科学中最危险的结果就是你所希望的结果，因为你会宣布胜利并变得懒惰。 大佬们永远不会止步于当前的胜利，也不会就此停住脚步，他们都在致力于研究可能的癌症治疗方法。 尽管...

问题 isoseq3 cluster 跑不出unpolished.bam

...三步都整成输出，但是做第四步时，一直运行，且得不到结果，本地日志文件也没有报错信息，cluster.log没有信息。 1.ccs m062922.subreads.bam movie.ccs.bam --noPolish --minPasses 1 -j 24 2.lima movie.ccs.bam primers.fasta movie.fl.bam --isoseq --no-pbi -j 24 ...

问题 各位老师好，无参转录组中挑出来的一段序列应该怎么进行后续的实验

我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组，搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因，但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。正在着手测基因组，但前期测了一个无参的转录组，从中挑选并得到一段序列，...