问题 分析方法

2个组织部分，在不同处理下，具有4次生物学重复的组学分析。 利用什么分析方法，可以在一张图中得到：不同处理，这两部分组织的之间的关系（聚类）

问题 最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，改了后还是出现以下问题

问题 GWAS分析中，PCA和群体结构分析，docker运行代码后最后均显示如下，segmentation fault，然后什么也不能生成，请问这是怎么回事

问题 老师，您好，RNAseq分析中，进行PCA分析时，为什么会有如下的报错，是给的R的脚本哪里出问题了吗？

问题 基于转录组的基因家族分析

没有参考基因组的话，做基于转录组的基因家族分析的时候，步骤和有参考基因组的有什么区别呢，学习正常的基因家族分析可以吗，或者是否有单独的课程教学呢

问题 转录组差异基因分析若干问题

1.分析时，是否可以去掉不好的基因（如缺失、无功能注释的）？ 2.分析时，是否需要补充某些基因的功能注释，以及它们对应的KEGG通路？ 3.多组韦恩比对时，差异基因少或共有基因太少，怎么才能保证其富集通路的准确性？ ...

文章 生存分析的一些基本概念

生存分析中有很多的新概念，需要了解一下。 生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法，也称生存率分析或...

问题 WGCNA分析基因的筛选

...需要再怎么筛选一下？ 样品是8组，24个样，可以用8组来分析吗，还是要用24个样分析？

问题 不同物种之间的共线性分析

在不同物种之间的共线性分析这一部分分析的最后一步,即运行命令 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout（出图时）出错，错误如图片所示 这是有可能哪里出错了？ ...

问题 Fst,pi, and ROD 分析

在进行选择消除分析  fst pi ROD  分析的时候，画出的图的染色体数目中间怎么少了几条？应该有28条染色体，只画出来19条。

问题 想要bsa分析和绘图的脚本

两个亲本两个子代，我想自己从vcf文件开始分析，之前报了那个49.9的bsa课程，但主要是从docker中操作，我想用R进行分析，我想咨询怎么才能得到那个脚本，很喜欢做出来的那个图。。。。

问题 老师，我这个是桑树的fasta和gff文件，不是从官网下载的。假如各个网站都找不到我想要的物种的基因组文件，只有手头这个文件，我要怎么做才能和教程的代码连接上呀？或者说碰到这种目标物种查不到的情况可以怎么做呢？

问题 基因结构分析

老师，想咨询一下像如图基因结构图中，有部分基因有部分结构相似甚至基本相同，这种情况正常吗？针对这类情况该如何分析或者如何解决比较好？

问题 单倍型分析

单倍型分析报错提示没有geneHapR这个包，用的就是pop-evol-gwas:v2.0镜像

问题 我的Conda 根本安装不成功软件，比如UMI tools ，怎么办

File "/disk2/user/yizhsu/biosoft/anaconda3/bin/umi_tools", line 5, in <module>     from pkg_resources import load_entry_point   File "/disk2/user/yizhsu/biosoft/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3260, in <module>     def _initialize_master_wor...