...行排序。由此一来就可以模拟细胞的动态变化。可能有的小伙伴有疑问了，为什么叫做伪时序分析呢？如果想要得到细胞分化轨迹，分化的时序分析，理论上的做法是设置多个时间点，每个时间点取一次样，进行测序以及后续的...
...评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。此前小编给大家解读了一篇针对过敏性哮喘疾病，利用WGCNA，鉴定关键模块和hub基因，筛选Biomarker的文献（链接），今天将介绍一篇新的文献：针对多形性胶质母细胞瘤，利用W...
...：生物化学和生物物理研究通讯， 这本杂志大家应该都比较熟悉吧， 最新影响因子2.705分，虽然不是很高，但也是爱思唯尔家的老牌杂志， 这本杂志年发文量巨大，其中有一半以上来自中国，又因为审稿周期短所以深受大家...
...在线发表题为“26 个不同玉米基因组的从头组装、注释和比较分析”的研究论文，该研究对 26 个玉米自交系的基因组进行了从头组装。基于已经发布的26个玉米自交系泛基因组，在本文中，作者进行了玉米的TPS基因家族分析。系...
... 3. 低温条件下093和120的代谢物和基因水平比较 a. 通过上述热图分析，在低温胁迫下两种基因型菜豆之间共观察到 102 个 DEM（差异表达代谢物）。之后通过KEGG数据库对差异代谢物进行注释得到75个...
...检查五个果实。 蛋白质组学分析 通过与猕猴桃基因组比较，共鉴定出2487个蛋白。按照P<0.05、上调>1.33倍、下调<o.75倍的差异标准，共鉴定出292个差异蛋白，其中196个上调，96个下调。 将鉴定出来的差异蛋白与KEGG、GO...
...和涉及的腋窝淋巴结。根据绝经状态对正常组织标本进行比较主要揭示了基质的变化。尽管与正常组织相比，癌前 BRCA1+/- 的微环境发生了适度的变化，但随着向肿瘤的转变，浸润免疫细胞显着增加，成纤维细胞随之减少。对代...
...“严进严出”成为常态。 这个阵势，不禁还引起了一阵小恐慌，读研真这么可怕吗?刚刚考研上岸的童鞋们，你们心慌不? 读研真有这么可怕? 这条上热搜的新闻是深圳大学早在3月15号就发布的一则通知： 从通知中我们可以...
...学基金建议资助项目申请人名单， 你中了吗? 学霸姐姐比较关注的是：今年基金委建议资助的国家杰青总数有300人！比往年都多， 是不是说明今年的竞争没那么激烈了呢? too naive! 尽管总量增多，但竞争依然激烈得惨不忍睹...
...件，支持输入GFA格式的文件可视化，在基因组组装中用的比较多，但是也可以展示泛基因组的结果；由于本人多用命令行工具，这个就不做过多介绍了。 odgi：https://github.com/pangenome/odgi，是一个专门用于可视化泛基因组的工具，...
...们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似~那么，他们如何转换呢？ GFF主要是用来注释基因组，格式如下： J15 glean gene 25308430 25309140 . + . ID=Gglean067903; status=novel;J15 glean mRN...
高通量测序会得到很多SNP，如何利用这些SNP是一项非常重要的工作；尤其在搜集筛选一些种质资源的时候，我们往往希望用最少的SNP区分尽量多的样品，也就是指纹图谱DNA fingerprinting，这在实际科研生产中是非常有用的、实用的...
...序列信息，在进行blast时，由于数据库较大，搜索时间会比较长，同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分，下面以nr库进行举例说明。 一、准备 1.1、数据： nr库：https://ftp.ncbi.nlm...
...冒号“:”分隔；同一cloud采用括号“()”组成整体。 3. 如何把化石时间加入到树文件当中？ 在想标定的节点后面以单引号加上时间范围。需要注意的是，如果后续需要使用mcmctree进行超度量树的构建，由于mcmctree的单位是100个...
...研究，其中尤以TMT/iTRAQ火热。那么，蛋白质组学类文章该如何撰写呢？好发么？在这里，小编给大家带来一篇今年9月份发表在BMC Plant Biology上的蛋白质组学文章。 材料方法 1、水稻黑条矮缩病毒RBSDV感染玉米幼苗作为感染组，...