...文件如下图，请问老师这个是因为共线性关系太多了吗？如何调整参数得到合适的图片呢？
...算表型解释率PVE 法二：可以选出显著的位点，使用简单回归模型（Im）进行拟合，获得R2值作为解释率。 如何根据effect，se，maf计算表型解释率PVE，公式如下： 其中： β为GWAS中的effect值 MAF为SNP的MAF次等位基因频率 se为GWA...
...互动与敏捷大咖产生了精彩的思想碰撞，大家就敏捷开发如何落地及技术人员如何转型晋升这两个话题做了深度探讨. 以下为敏捷专家薛军和李林在敏捷狂欢大会上的演讲分享 为什么腾讯产品最好 2017年5月份，网上有...
GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件，他的下载比较简单，但是今天在配置的时候出现了一点小问题 下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gztar zxvf gatk-4.6.2.0.tar.gzcd gatk-4.6.2.0 配置 ./gradlew bundle ...
...保持一致，以最大限度的减小对后续基因与蛋白差异表达比较分析中所产生的误差。 最后，两者关联分析的主要内容包括哪些？ 1、针对无参考基因组的物种，可以利用转录组测序构建蛋白数据库，这将大大提高蛋白的鉴定数...
...并对变异信息进行质控过滤，变异信息在染色体上的分布比较，统计信息；这些都是常规重测序变异检测分析内容； 重要的分析内容, 也是文章的亮点在于，作者额外鉴定了甜瓜基因组中一类疾病抗性基因家族（NBS），NBS基...
上午学习了家族分析。下午断网后，重新开机，打开docker，出现小鲸鱼。 输入命令行“docker run -it -v /d/blast:/work --rm omicsclass/blast-plus:latest”，出现的界面如下： 但是我想进入基因家族学习。于是关闭docker，重新开启后，输入...
...究认为NMDS的效果优于PCA/PCoA。检验NMDS结果的优劣用胁迫系数（stress）来衡量，此值越小越好，当小于0.2是可以用NMDS的二维点图表示，当stress<0.05时具有很好的代表性： 注：stress值越小越好UPGMA聚类分析 基于以上方法分析得...
...将生物实验室分为4个等级，简称P1、P2、P3、P4，按照安全系数分级，数字越大安全系数越高。 第四级即P4实验室是生物安全最高等级，可有效阻止传染性病原体释放到环境中，同时为研究人员提供安全保证。 P4实验室是干啥的?...
...且恒等的。 UPGMA法计算原理和过程: ①以已求得的距离系数,所有比较的分类单元的成对距离构成一个t×t方阵,即建立一个距离矩阵M。 ②对于一个给定的距离矩阵,寻求最小距离值Dpq。 ③定义类群p和q之间的分支深度Lpq=Dpq/2。 ...
... 问题一：细胞生长缓慢 细胞长得慢是细胞培养过程中比较常见的问题，一般来说，细胞活力和浓度一直是细胞健康的标志，细胞长得慢的话，活力和浓度可能都会直线下降。 造成细胞生长缓慢的主要原因及解决方法： 1，...
...制的结果对布局文件进行相应的调整。如果大家觉得这里比较难以理解，不妨对照着后面的绘图结果进行梳理。 绘图流程 我们所说的局部共线性，也就是目标基因所在的染色体区域在物种间的共线性情况，所以我们需要所有...
...中谋求一定的市场地位，把握利好的产业发展契机。 如何提升中小项目型软件企业的项目管理能力？ 对于项目型企业，仅仅关注项目管理系统建设，还是无法获得综合能力的提升。因为单一的项目管理系统不能解决包括客...