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问题 我的fasta文件是由scaffold组成的,不是直接的A01和C01之类的,然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错,该怎么调整

文章 circos-调整基因组圈图的图片大

...tutorials/reference/image/  针对图片大的参数是radius* 譬如调整如下: <image><<include etc/image.conf>> radius*=2000p</image> 推荐课程: 基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 更多生物信息课程: 1. 文...

问题 RNA-seq的转录水平表达分析HISAT, StringTie and Ballgown 中R语言的疑问。

...试着用自己的数据去跑这个流程,前面都很顺利,就是在比较男女之间基因表达差异那里出了错误,因为我的数据是从米的根,茎,叶三个不同组织里得到的,所以我想比较这三个不同组织的基因表达差异情况,但是R代码我...

文章 热图竟然还能用Excel来画?

...最大值最对应红色,可以获得如下结果: 2、样式调整 基于前一步的结果进行调整,例如隐藏所有的数字,需要注意数字和颜色为对于关系,不能直接删除。操作过程为:选中数据区域——右键单击——选择设置单元格...

文章 在线绘制聚类热图(heatmapper)

...进行相应设置即可完成聚类热图的绘制。 如果基因数目比较多,基因名称显示会不清晰,我们可以将图片下载下来,然后再使用其他软件进行修改,比如使用AI进行修改。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现...

文章 vscode如何下载安装并连接服务器

https://code.visualstudio.com/ 直接去官网下载自己版本的安装器 跟随指引一步一步安装,都是中文的 注意,如果是windows,则在附加任务部分按下图勾选安装完成后打开软件,这里以mac为例,windows也是一样的,选择extensions选项(即...

文章 windows 中的docker如何设置容器的内存与计算资源 hyper-V

....com/question/4584 建议: 对于高通量测序数据,数据量都比较庞大,一般的笔记本电脑都不能胜任(内存限制),只能做练习使用。如果要分析数据尽量选择内存多的台式机或者服务器。 组学大讲堂云服务器即买即用,避免安...

问题 老师,在第三步vcf文件过滤时,得到的all.clean.vcf文件太了,宽松设置调整数值后,依旧很,怎么办啊,有没有其他的方法,可以让最后的数据大一些啊

文章 如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

...算表型解释率PVE 法二:可以选出显著的位点,使用简单回归模型(Im)进行拟合,获得R2值作为解释率。 如何根据effect,se,maf计算表型解释率PVE,公式如下: 其中: β为GWAS中的effect值 MAF为SNP的MAF次等位基因频率 se为GWA...

文章 Mapchart位置坐标数点后数字调整

Mapchart  可以用来绘制基因染色体位置图 (https://www.omicsclass.com/article/397),图片中可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置: 设置初始图片后,选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置Absolute ...

文章 CORNERSTONE对话腾讯&华为敏捷专家

...互动与敏捷大咖产生了精彩的思想碰撞,大家就敏捷开发如何落地及技术人员如何转型晋升这两个话题做了深度探讨.   以下为敏捷专家薛军和李林在敏捷狂欢大会上的演讲分享   为什么腾讯产品最好 2017年5月份,网上有...

问题 MCScanX共线性图与拟南芥示例有些不一样

...文件如下图,请问老师这个是因为共线性关系太多了吗?如何调整参数得到合适的图片呢?

问题 hmmer搜索结构域

...失较多的基因,CDD数据库中却显示有结构,是不是要个别调整一下,还是遇到了那种正负链结构不同的比如这种,是不是要从正链调整到负链,这种怎么调整

问题 请问win11家庭版上刚开始基于hyper-v安装了docker,后来调整docker设置变成基于WSL2安装docker,然后请问这样可行吗?怎么使用?

原来基于hyper-v安装了docker,然后刚好看到说是可以直接基于WSL2安装docker,于是接着在docker桌面版上修改参数,选中WSL,然后选中ubantu.那这个后续怎么使用docker啊?是在cmd中使用,还是在ubantu使用?这个在ubantu上是这个样子,在...

问题 docker安装后,windows与虚拟机之间的数据如何挂载?

上午学习了家族分析。下午断网后,重新开机,打开docker,出现鲸鱼。 输入命令行“docker run -it -v /d/blast:/work --rm omicsclass/blast-plus:latest”,出现的界面如下: 但是我想进入基因家族学习。于是关闭docker,重新开启后,输入...