找到约 15 条结果

文章 Adobe illustrator将矢量图转换成位图

...位图的,譬如常见的tiff、png、jpg等格式的图片文件。 如何利用Adobe illustrator(一下简称Ai) 将矢量图pdf文件或者svg文件转换成tiff等文件呢? 1、打开Ai ,由文件--打开--选择相应要转换的pdf文件 打开结果如下: 2、导出tiff /p...

文章 R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

...的相关性,通常的做法是利用表达量数据计算皮尔逊相关系数,然后设置一定的阈值进行筛选,再进行一些图形展示。 以下用一个例子带大家了解一下R计算相关性常用的两种方法: 我先模拟两个数据集,有两组样本A和B,每...

文章 MUSCLE软件介绍

...列间的相似度 6)计算 Kimura 距离矩阵,构建发生树 7)比较新生成的树和原来树的差异,如果有节点的重排,跳转到步骤 4 8)从树上砍断一个枝,产生两个子树,每次砍断的位置是按和根的距离降序排列的 9)分别计算两个...

文章 误差线该用标准差还是标准误?

...的范围也就如下): 2、 σ(总体标准差)未知,且为样本(一般样本量于30,很多生物研究类实验样本量往往少于30且σ未知),则选择t-分布:t*也是通过t-检验查表获得,其数值与置信度以及自由度(n-1)有关(此处适...

文章 剑桥女大学生跳机自杀:学术研究遇到瓶颈到底怎么解决?

...一些更简单、更有可能得出积极结果的事情, 比如一个的实验、或者一次长跑等等。 即使是微的成功,也能让你在漫漫几个月毫无进展的过程中都鼓舞到自己的士气,让自己感觉有所收获。 4,你一定要明白:科研...

文章 avereps相同ID取均值(limma包函数)

...t或者EList,后两者涉及芯片数据标准化过程,此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。 指定数据如下:相同type取均值 > dat   type Num1 Num21     A   90   892     B   34   323     C   56   534     D   99   9...

文章 利用Hiplot网站进行热图绘制

...有MeV软件、Excel、R语言ggplots绘图等等,今天给大家介绍如何在Hiplot网站中绘制热图,只需要导入固定格式的数据文件,就可快速输出聚类热图。 绘制热图是Hiplot的基础模块功能之一,除此之外,也可以绘制转录组数据分析中常...

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

...a <int> Orthofinder除-a涉及的几个步骤外,运行地都相对比较快和高效,所以-a参数不会有大的影响。这个参数在OrthoFinder分析提前计算好的BLAST结果时更有用,但需要提供更大的RAM     -d 当输入文件是DNA序列时指定该参数  ...

文章 两分钟看懂基因组注释GFF文件

...对组成的注释信息描述,不同属性之间以分号相隔,信息比较多我们一一解释: ID--注释信息的编号,在一个GFF文件中必须唯一 Name--注释信息的名称,可以重复; Alias--别名 Parent--指明feature所从属的上一级ID。用于将exon...

文章 组学大讲堂 | 《蛋白质组数据分析实操》课程上架

...饰、定量蛋白质表达水平。质谱分析会得到大量的数据,如何利用软件及算法对质谱下机数据进行充分挖掘,高效、精准分析是研究的关键环节。 为了助力科研工作者深入了解蛋白质组质谱数据分析方法,提升相关分析能力,...

文章 加权基因共表达网络(WGCNA)寻找与疾病相关的hub基因

...的基因变成了miRNA,分析思路几乎与上篇文章一致。这里编就不详细介绍了,有兴趣的可以查看原文; 胃癌中共表达网络分析及关键biomarker查找WGCNA构建微生物互作网络 微生物中WGCNA的应用 下面的文章研究了531位芬兰男性...

文章 melt函数对数据进行整合

reshape2包melt函数对数据进行整合,比较常见的就是利用ggplot2包进行图片绘制的过程中往往需要对数据进行整合,melt()的使用方法如下:加载R包以及案例数据 library('reshape2') dat  type  sample1  sample2  sample1  sample21    A 6.33...

文章 dQTL.seq方法研究基因定位

...高基因检测功效。 其中dQTG-seq2方法可以处理基因效应较或显性比太大的情况,对保留的每个极端表型个体DNA或RNA样品进行深度测序,利用观测的标记等位基因和基因型数目来检测效应和极端超显性基因。 1. 工具准备 下...

文章 抗独特型抗体制备常见问题解析

抗独特型抗体开发的常见问题解答 一、如何有效筛选出非竞争型抗体? 首先,在血清效价检测中,使用竞争ELISA的方法对不同动物血清中的免疫反应进行评估,选择竞争抑制率相对低一些的动物进行杂交瘤融合。接下来,在主...

文章 pfam上不去 打开后搜索没有反应

...VPN可到商城兑换下载服务:https://www.omicsclass.com/goods/12 如何知道自己的基因家族PF号:https://www.omicsclass.com/question/268 更多生信相关课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链...