问题 学习基因差异性表达后不知道如何提取mRNA的表达量

ref里也没有提供mRNA-info文件

问题 PASA update 报错

...mn 'model_id' at row 1 at /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/PerlLib/DB_connect.pm line 223.Thread 4 terminated abnormally: failed query: <insert into annotation_updates (gene_id, model_id, alt_splice_flag, before_gene_obj, after_gene_obj, compare_id, is_valid, have_before, have...

文章 使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗？

...可以不用做IndelRealigner处理bam文件。 基因组重测序数据分析视频课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ或者扫码二维码：

问题 下载的gff注释文件中没有 两端 UTR信息，有没有批量识别UTR的工具或者网站？

如题。物种基因组虽有，但是质量不是太好，提取pormoter得到长串的“NNNNNNNNNNNN”。用别的基因组版本的话，没有UTR信息， 请问有没有批量识别UTR的工具或者网站？

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

...便学习我们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据做数据挖掘，这里开始记录一下不同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析，提高分析数据效率，今天是第1个数据，后续还有数据...

问题 用bHLH的第一个pfam号hmmer搜索不出来,是哪里出问题了？

问题 虚拟机导入成功，但是设置的时候出现问题，发现无效设置，OK键也不反应

问题 请问一下基因结构图不显示UTR是啥原因？这个图做成这样正常吗？

问题 运行orthofinder出现这个警告，跑不出来直系同源单拷贝基因，如何解决这个问题啊？？

问题 MEME网站下载的motif图片中基因不全，只有网页中显示出来的基因。

问题 Tassel表型文件和基因组文件样本量不一样

我有一个包含300份材料的自然群体，群体的重测序数据也有，但是表型数据只有两百多个材料的，我需要对重测序的vcf文件进行修改，剔除没有表型数据的材料的重测序数据吗？

问题 安装Linux系统过程中出现了不明白的错误 不能打开一个新任务

不太明白这个指令的意思，请问怎么处理？谢谢

问题 我再ITOL上传了进化树文件，为什么总显示图片的结果，不知道是nwk文件出了什么问题

我再evolview中也上传了这个文件，总是加载不出来，一直在这个界面，里面是你什么原因呢？

问题 基因id与cds id不一致，无法提取cds序列怎么办

这是gff文件 这是bed序列 这是cds序列

文章 甲基化水平如何计算

...色体、位置、甲基化读数和覆盖深度： chr1    1000    5   10chr1    2000    3   6chr1    3000    4   5chr2    1500    6   10chr2    2500    9   10 在这个数据中： 第一列是染色体名称。 第二列是位点位置。 第三列是甲基化...