大多数GWAS分析采用自然群体,表型数据为编号后跟性状即可。那么有系谱记录的群体是否需要对表型做啥处理呢?还是把亲缘关系矩阵算进去就可以了?
R语言怎么写循环,对多个元素进行重复操作?AlQWT_vs_AlQC14_id = data.frame(AlQWT_vs_AlQC14$Mapped.ID)AlWT_vs_AlC14_id = data.frame(AlWT_vs_AlC14$Mapped.ID)OAlWT_vs_OAlC14_id= data.frame(OAlWT_vs_OAlC14$Mapped.ID)OQWT_vs_OQC14_id= data.frame(OQWT_vs_OQC14$Mapped.ID)PQWT_vs_PQC13_id=...
这是gff文件 这是bed序列 这是cds序列
使用两个种的蛋白序列用MEGA构树时,显示序列无效;检查了蛋白序列没有什么问题,序列最后的*字符已经删除;分别用每个种的蛋白序列试了试,显示还是序列无效
...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...
怎么计算自己这个物种的突变率呀??画stairway-plot里有这个参数不知道怎么算,手里有vcf文件
通过verkko v2.2.1版本进行基因组组装后,直接生成了挂载好的genome.fa文件,但是里面有些染色体需要手动调整,我如何区生成.hic和.assembly文件,我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对,但是verkko的组装结果文件...
如何将这行命令 perl bin/indel_p3in.pl QT4indels2.in genome.fa con.txt,写成一个shell脚本即*.sh的形式