lefse分析前需要对组分数据进行clr转换吗
...为主流的单细胞转录因子分析工具，SCENIC在单细胞转录组数据构建基因调控网络、转录因子分析以及细胞状态鉴定方面上表现优异。目前主要有R和python两个版本，支持分析人、小鼠和果蝇的数据。 1.1 pyscenic分析流程 1.1.1 构...
...我国女性乳腺癌发病数将达23.4万例，比2008年上升31.15%，数据触目惊心。 据报道，全球每100个新确诊的乳癌病例中，有12个来自中国，新发病率增长速度是世界平均水平的2倍，平均发病年龄比西方国家早10-15年。 5年生存率提...
可视化数据时，色彩往往是最欠考虑的因素。的确，在一个图中，数据的选择和图表类型的确定才是最重要，最需要确定的因素。但是，适当的选择颜色不仅仅能使数据图的阅读者赏心悦目，而且有助于图中数据关系的呈现，使...
已经检查数据全是数字：
这个代码报错我看不懂，请问老师这个要如何解决呀，我用的是自己下载的昂飞芯片数据
...执行合并模拟，使用位点频谱（SFS），推断最适合所观察数据的模型参数。 fastsimcoal2最关键的步骤就是完成自己的配置文件，接下来将会介绍配置文件中需要有哪些信息。 用途： 使用fastsimcoal2模拟基因数据有3种方法： 1. ...
举个例子：从数据库中下载基因组数据，基因组.gff文件中染色体ID较为复杂（第一列） 从全基因组序列.genome.fa文件中找到染色体ID对应简写 想将gff文档中染色体ID全部替换成第二列LC*命名 use Data::Dumper; use Getopt::Long; use strict;...
...息，而维恩图通常只能粗略估计。 3.UpSetR包绘图 准备的数据文件格式如下： all_deg_id CK_vs_A CK_vs_B CK_vs_C CK_vs_D CK_vs_E ENSRNA049471043 1 1 0 0 1 ENSRNA049471090 1 0 0 0 0 ENSRNA049471102 1 1 0 0 0 ENSRNA049471535 1 0 1 1 0 ENSRNA049473455 ...
课程数据资料提供了一个名为koeken1.py的脚本，运行报错koeken1.py 是否还有其他脚本可以使用？
要不我把数据发给你，你计算一下？或者你再我服务器上计算一下。
对于大批量的数据下载，手动下载无疑是繁琐而又痛苦的，若不巧再碰上网站不稳定，小圆圈转半天就是不出来，此刻的人生必定是绝望的。 对此，小编深有体会，只70多个基因，就用了三四个小时来下载，费时又费力。...
...mputational gene sets：计算基因集合，通过挖掘癌症相关芯片数据定义的基因集合C5: GO gene sets：Gene Ontology 基因本体论，包括BP（生物学过程biological process，细胞原件cellular component和分子功能molecular function三部分）C6: oncogenic signatures...
老师您好，我想问一下，我做的转录组数据，处理与未处理之间的差异显著的基因，上调基因远远大于下调基因，怎么解释原因呢？谢谢老师
...joint calling的方式进行分析，最终会获得单个样本的变异数据。这种文件很难对同组不同样本进行差异SNP分析，此处就需要对文件进行合并。vcf文件的合并有很多的软件可以做，主要的就是GATK、vcftools和bcftools三种，但是具体的合...