...和涉及的腋窝淋巴结。根据绝经状态对正常组织标本进行比较主要揭示了基质的变化。尽管与正常组织相比，癌前 BRCA1+/- 的微环境发生了适度的变化，但随着向肿瘤的转变，浸润免疫细胞显着增加，成纤维细胞随之减少。对代...
...件，支持输入GFA格式的文件可视化，在基因组组装中用的比较多，但是也可以展示泛基因组的结果；由于本人多用命令行工具，这个就不做过多介绍了。 odgi：https://github.com/pangenome/odgi，是一个专门用于可视化泛基因组的工具，...
在 蛋白质定量—MaxQuant软件的使用 这篇文章中介绍了如何使用MaxQuant进行蛋白质定量。但是只适用于样品少（11个样品以内）的分析，但是如果样品特别多（比如有18个样品）时，标记是不够用的，这时候可以将样品分成3组分析...
...学基金建议资助项目申请人名单， 你中了吗? 学霸姐姐比较关注的是：今年基金委建议资助的国家杰青总数有300人！比往年都多， 是不是说明今年的竞争没那么激烈了呢? too naive! 尽管总量增多，但竞争依然激烈得惨不忍睹...
...行排序。由此一来就可以模拟细胞的动态变化。可能有的小伙伴有疑问了，为什么叫做伪时序分析呢？如果想要得到细胞分化轨迹，分化的时序分析，理论上的做法是设置多个时间点，每个时间点取一次样，进行测序以及后续的...
...序列信息，在进行blast时，由于数据库较大，搜索时间会比较长，同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分，下面以nr库进行举例说明。 一、准备 1.1、数据： nr库：https://ftp.ncbi.nlm...
...评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。此前小编给大家解读了一篇针对过敏性哮喘疾病，利用WGCNA，鉴定关键模块和hub基因，筛选Biomarker的文献（链接），今天将介绍一篇新的文献：针对多形性胶质母细胞瘤，利用W...
...美国国籍，加入了中华人民共和国国籍。所以，这个情况比较尴尬，目前大家公认的是2枚诺贝尔奖。而世界公认的诺贝尔奖最具重量级奖项是的是——科学领域的奖项，除去莫言大师的文学奖之外，我国目前只有屠呦呦1人次获...
...们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似~那么，他们如何转换呢？ GFF主要是用来注释基因组，格式如下： J15 glean gene 25308430 25309140 . + . ID=Gglean067903; status=novel;J15 glean mRN...
...“严进严出”成为常态。 这个阵势，不禁还引起了一阵小恐慌，读研真这么可怕吗?刚刚考研上岸的童鞋们，你们心慌不? 读研真有这么可怕? 这条上热搜的新闻是深圳大学早在3月15号就发布的一则通知： 从通知中我们可以...
...冒号“:”分隔；同一cloud采用括号“()”组成整体。 3. 如何把化石时间加入到树文件当中？ 在想标定的节点后面以单引号加上时间范围。需要注意的是，如果后续需要使用mcmctree进行超度量树的构建，由于mcmctree的单位是100个...
高通量测序会得到很多SNP，如何利用这些SNP是一项非常重要的工作；尤其在搜集筛选一些种质资源的时候，我们往往希望用最少的SNP区分尽量多的样品，也就是指纹图谱DNA fingerprinting，这在实际科研生产中是非常有用的、实用的...
...体分析的插件。它可以将基因列表与基因本体数据库进行比较，帮助用户了解基因在功能和过程上的富集情况，从而揭示基因的生物学意义。 clusterMaker2插件：clusterMaker2是一个用于聚类和可视化分析的插件。它提供了多种...
...能直接将其解释为细胞分数，也不能在细胞类型之间进行比较。但是，使用定量验证显示估计分数与真实细胞分数之间具有高度相关性，从而证明了MCP-counter在样品间比较中的价值。为了证明这些估计的预后价值，MCP-counter已用...
... 5个方面就像鱼的“主刺”一样，每个主刺上还有很多的小刺，这些小刺就是与主刺相关的问题，来构成了一条难以下咽的鱼骨头，如果不拔掉，一不小心就会卡住喉咙，让人痛苦不堪。 4、PDCA循环 Plan:制定目标与计划 Do...