...有结构域缺失的序列想做做蛋白质全长多序列比对看看，结果发现序列缺失，如图：，但是前期在数据库看的时候确实有这个结构域如图，打开WRKY_pep_final_aligned文件后发现是这种情况：，但是其他序列比对后是，感觉是muscle -ali...
...ly top 31563574 reads are used in downstream analysis.这个问题，组装结果中只有一条8000bp左右的序列，请问怎么设置参数才能不 only top reads进行后续分析，而能够使用全部reads进行后续分析
...群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 ...
...局限性：对样本大小较敏感，不均衡的样本大小可能影响结果的稳定性和解释。 •使用场所：广泛应用于生态和环境科学中，比如评估不同环境条件下的物种多样性或群落结构差异。也适用于任何需要测量和比较群组间相似性...
...果： library(scales) show_col(rainbow(10),labels=T) #labels控制是否显示HEX格式的色值信息. 接下来我用一个版面矩阵将五个色盘颜色全部显示出来： par(mfrow=c(1,5),mar=c(0.5,0.5,2,0.5),xaxs="i",yaxs="i") n<-1000 barplot(rep(1,times=n),col=rainbow(n),border...
...基因家族分析 3. 转录组越做越普遍，实验必备，看不懂结果？不会深入分析？自学都可以搞定，学习链接：有参转录组自主分析实操 ；转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ； 4. 代谢组分析硬件要求不高，个人电脑就...
...里最最普通实验技术了，那为什么很多人都跑不出漂亮的结果呢? 那是因为，它虽然简单，但是处处都是坑啊! 从蛋白提取到ECL底物曝光，你可能会遇到各种各样的问题： 繁琐的制胶、跑胶、转膜、成像步骤、一不小心还信号...
...fuck.fa -d fuck.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o fuck.blast影响了结果。请老师解答一下这个问题，不胜感激！！！
...跟随者或粉丝数)指标定义的工作成就呈正相关。 最后的结果表明： 在拥有同样数量的论文的前提下，满面笑容的科学家们的论文质量更高、被引次数也更多， 且他们的最新信息吸引的跟随者或粉丝也更多， 在控制年龄和性...
4月份我提问过一个类似的问题。一个老师说：“分染色体运行后，你需要用GATK的CombineGVCFs合并结果 ，先按染色体合并样本，最后合并不同染色体的vcf文件”。这个具体是怎样操作的，能不能写一下命令。
...有字数提示)；同时也可以上传word/TXT文件进行查询，检测结果可点击 Compare Text 查看。 网址：http://www.duplichecker.com/ 4. Plagiarisma系统 该网站既可以直接粘贴检索文字(支持190+种语言)，也可以查询特定网页，当然也可以上传文...
...过滤，这一步 过滤 掉该组所有样本都为0的otu是不会影响结果的吧？
...工作目录 setwd(work_dir) # 下载基因表达量，count数格式的结果 DataDirectory <- paste0(work_dir,"/GDC/",gsub("-","_",projects)) FileNameData <- paste0(DataDirectory, "_","Gene_HTSeq_Counts",".rda") # 查询可以下载的数据 query <- GDCquery(project = project, ...
...说明： -c 输入拷贝数变异数据经过GISTIC软件分析过后的结果文件： Gene SymbolLocus IDCytobandTCGA-3Z-A93Z-01A-11D-A36W-01TCGA-6D-AA2E-01A-11D-A36W-01TCGA-A3-3306-01A-01D-0858-01TCGA-A3-3307-01A-01D-0858-01TCGA-A3-3308-01A-02D-1322-01ACAP31169831p36.33-0.0010.0020.0090.0150.0...
老师，您好。关于QTL-seq有些问题想请教下：（1）给出结果中95%和99%的置信区间具体是怎么计算的？（2）候选基因是在超出阈值线的区域吗？如果都没有超出，该如何解决，能否适当降低阈值，比如设90%置信区间，该怎么计算。...