利用gapit，FarmCPU模型做GWAS分析的时候出现ERROR，其它模型都能正常运行，得到结果，并且可视化，FarmCPU分析的时候就会出现ERROR，没有动过脚本
...-trimmed-sequences primer-trimmed-demux.qza # Summarise the reads 查看结果 qiime demux summarize \ --i-data primer-trimmed-demux.qza \ --o-visualization primer-trimmed-demux.qzv \ #双端合并 qiime vsearch join-pairs \ --i-demultiplexed-seqs primer-trimmed-demux.qza \ --p-thread...
...源基因是相同的基因，而旁系同源基因是早期基因复制的结果，因此有更多的时间来分化。 基于这一理解诞生了第一个大规模的直系同源预测方法，即“双向最优匹配” (bidrectional best hit, BBH) 法，它考虑的是互为比对得分最高...
...ical analyses. 作者是用的2-ΔΔCT的方法做的数据分析，可是结果怎么会是负数呢？ 在问答社区内看到莫非他是用的-ΔΔCT？恳请老师们解答，谢谢了
...怎么放到家目录下之类的？ 新补充细节：直接运行结果如下，说是没有配置文件，怎么办
...-minGQ 80 --min-alleles 2 --max-alleles 2 |gzip - > all.clean.vcf.gz 结果是After filtering, kept 0 out of a possible 118111 Sites（中间很多Warning），于是把参数全部拆开一次只过滤一个参数，发现除了--min-alleles 2 --max-alleles 2，可以过滤成功：kept 106...
如上图，输入sft代码后，没有给出合适的powerEstimate。我根据R2值不小于0.8，slope值接近-1，平均连通性尽可能大的原则选择了power值等于7，是否合理？根据图中的数据，本次数据是否适合做WGCNA的分析，结果的可靠性高吗？
...值出现问题，而值来自于相关性计算后的矩阵，发现矩阵结果为： 原因是用cor()计算相关性时，矩阵中存在NA，cor()计算前增加na.omit() 即可，修改为： d<-round(cor(na.omit(fpkm)),4)
...绿体GetOrganelle组装不成环，按照植物叶绿体组装后，发现结果不成环状，要怎样调整其成环呢 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)的方法调整后，还是出现问题： 1、GetOrganelle组装：增加轮数（-R选项），重新指定更近缘物种的...
...柱状图,但是我懒得查资料,所以我尝试让ai帮我画一下 结果如下,这个是完整 的链接 https://www.cici.com/thread/w0ed44c9006bd080c 还是可以的 示例数据,没啥区分度,看起来不是很好看,也正常,但是直接就有了框架,还是很好的,毕竟后面...
...列中motif的分布情况。请问该如何批量操作？ 在得到的结果文件中，有看到下图所示的motif信息。[ ]之间的括号以外的数字表示motif编号，但是不知道该如何批量提取。 非常期待老师的回复！
...amtools。命令行格式：samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在你的序列文件名后面多了一个fai，文件合适如下： 211000022280750 9865 142631474 60 61211000022280526 9368 142641578 60 61211000022279869 9...
...综合征的表型产生了新的机制假说，也验证了现有的观察结果，例如肥胖和患有多囊卵巢综合征的女性与精瘦的多囊卵巢综合征相比更高的共患率。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32695266/ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32210915/ ...
mapping值最高30最低25，并且物种分布结果中也有其他物种，有几种水平较高，但与样本均为一个属。那出现这样的情况是什么原因呢？之前这株菌在两三年前也已经做过鉴定了，所给的参考序列就是这个物种的，之前在板上的表...
可以搜索出来但是仍然是空白文件