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文章 monocle3分析结果解读

...连续模拟细胞之间的转录相似性。相比以往熟知的Monocle2，Monocle 3经过了重新设计，使之可以用于分析大型、复杂的单细胞数据集。Monocle 3的核心算法具有高度可扩展性，可以处理数百万个细胞。软件主要可以执行三类分析：1）...

问题 两个基因是片段重复基因对，序列完全一致，但是KA/KS值为NA

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文章 如何打印机连接打印机

打印机型号：HP LaserJet Pro MFP M227fdw 连接方法： 1.下载驱动 驱动下载地址：https://support.hp.com/cn-zh/drivers/selfservice/hp-laserjet-pro-mfp-m227-series/9365384 2.安装驱动 双击下载好的驱动程序开始安装。 选择自动设置。 列...

文章 racon 安装报错：

...E_BUILD_TYPE=Release -DZLIB_LIBRARY=/share/work/biosoft/zlib/lib/libz.so.1.2.8  -DZLIB_INCLUDE_DIR=/share/work/biosoft/zlib/include ..

文章 linux清屏的几种方式

...入新命令时，会使用 clear 命令或 reset命令清空当前屏幕2.快捷键也能实现相同的功能：ctrl + l(小写的L)3.经常会遇到这种情况：在命令行窗口输入了很长的一段命令加命令参数，却发现输入错了，想清空怎么办呢 ?清空当前输入...

问题 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

|> 20250317 15:57:04.699 -|- FATAL -|- Runner -|- 0x7fb76cda1780|| -|- unsupported sequencing chemistry combination: binding kit: 100236500 sequencing kit: 100356200 basecaller version: 2.3.0.0.140640 另外尝试了不同的ccs版本都报一样错,有遇到过同样问题的大佬求指教...

文章 R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

...出现的频率得到结果绘制饼图： 统计数据，以及ggplot2绘图饼图代码如下： library(reshape2) local({r <- getOption("repos") ;r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" ;options(repos=r)}) library(ggplot2) library(cowplot) library(RColorBrewer) ...

问题 学习有参转录组分析中遇见的问题

...的步骤操作，但是第一个问题就难住了我，我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候，系统提醒这个命令找不到，如图片所示，这是怎么回事呢？我用的是Linux系统虚拟机操作的。感谢回答！

文章 DELL R430服务器用U盘安装Linux步骤

DELL R430服务器用U盘安装Linux步骤： 1、  第一步制作U盘启动，将下载好的CentOS64位系统用UitraISO打开，写入硬盘映像。 2、  注意选择U盘，最后写入 启动盘制作好，设置从U盘启动

文章 IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

​“ 2024年6月Frontiers in immunology 杂志发表了一篇题为Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis 的转录组分析文章 ” 文章借助单...

文章 linux中进程状态

...有5种状态:   1. 运行(正在运行或在运行队列中等待)  2. 中断(休眠中, 受阻, 在等待某个条件的形成或接受到信号)  3. 不可中断(收到信号不唤醒和不可运行, 进程必须等待直到有中断发生)   4. 僵死(进程已终止, 但进程描述...

问题 请问一下prefetch下载的问题

sratoolkit 2.10.5和aspera 3.9.1都安装好了，但是用prefetch SRRxxx 没有自动调用，还是通过https下载，而且比网上看到的很多都要慢。 在网上又找到这种方法prefetch -t ascp -a "/home/user/.aspera/connect/bin/ascp|/home/user/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa...

文章 不均等坐标系绘制

...om_boxplot() +  xlab(NULL) +  ylab(NULL) +  scale_y_log10(breaks = c(1, 2, 5, 10, 50, 100))print(p) scale_y_log10可以将y轴的刻度转换为对数刻度，具体来说是对数底为10的刻度。其作用是使y轴上的数据在对数尺度上均匀分布。 假设有一组数据，其y...

文章 aspera上传数据的时候老是链接中断，一晚上的时间白白浪费了，怎么办？

...1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接...

文章 WGCNA、生存分析、ROC共同筛选biomarker

...从而验证结果并筛选Biomarker。再次下载GEO数据库数据：GSE24084数据，基于ROC曲线分析，对hub基因进行验证，同样筛选Biomarker。数据分析 下载GSE50161数据，利用limma包进行标准化处理，之后针对47个样品的数据进行差异表达基因的...