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问题 老师,我的gene-ID和mRNA-ID用mRNAid_to_geneid.pl提取出来,是一整行是好几列,是什么情况,您帮我看看这个要怎么弄?

问题 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 运行下去,出现下面的情况,请问是是我的python有问题?

问题 老师,在ensemble下斑马鱼和大黄鱼的时候,gff3文件和pep等的ID统一的,老师给的脚本无法使用,我现在还没能看懂脚本并修改(捂脸)

问题 Plot_MultiPop.pl -inList ld_stat.list -output ld_stat.multi 请问这一步要怎么设置,可以提高图片的分辨率呢? 有点清晰

问题 老师我已经用gemma找到了显著位点,现在想将两位点之间连锁平衡程度r方大于0.35,且标记之间距离在300KB以内整合成一个qtl,应该用什么命令啊?

问题 老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

文章 Evolview绘制进化树时添加热图

...一下:1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结...

文章 植物转录因子调控分析

今天介绍一个植物的转录因子调控的综合性分析网站plantregmap,该网站的功能非常的强大,其主要功能包括如下: 1. 植物转录因子预测    输入蛋白序列或者核酸序列即可对是否是转录因子进行预测,如果是转录因子,会对转...

文章 组学大讲堂 | 《蛋白质组数据分析实操》课程上架

...类复杂,想要筛选出核心蛋白质,需要借助生物信息学的分析方法。 现如今最常用的蛋白质组学技术是通过质谱分析去鉴定蛋白质、分析蛋白质的修饰、定量蛋白质表达水平。质谱分析会得到大量的数据,如何利用软件及算法...

文章 evolview 3.0最新更新美化进化树

.../www.omicsclass.com/article/671 最近evolview 已经更新到全新的3.0版本:https://www.evolgenius.info/evolview/ 又发了一篇NAR级别的文章,很是让人羡慕: Balakrishnan Subramanian, Shenghan Gao, Martin J Lercher, Songnian Hu, Wei-Hua Chen, Evolview v3: a webserver for visu...

文章 TCGA数据分析ceRNA的套路

...     1.5. ceRNA 网络中的基因,lncRNA 进行表达量的相关性分析     1.6. ceRNA网络中miRNA, Gene, lncRNA 进行生存分析     1.7. ceRNA 网络中的基因进行GO,KEGG功能富集分析  2. 研究结果 2.1 差异表达分析    2.1.1 基因差异表达分析聚类...

文章 blastn使用方法及结果详解

...格式 还有其他的参数 -max_target_seqs:设置最多的目标序列匹配数 -num_threads:线程数,指定多少个cpu运行任务 等等 另一种情况,序列本身进行比对,也就是序列自己和自己比,可以发现内部的一些重复 blastn -query aaa.fasta -subj...

文章 R语言中%>% 作用

...性,尤其是在处理数据框的多个操作时。 在R的现代数据分析工作流中,%>% 是非常常用的操作符。

文章 最尬论文造假:某作者对存在的基因进行实验,还成功发表SCI!

学术造假这种事儿,每年都层出穷, 有人伪造实验数据,有人侵吞他人学术成果, 有人知知网,还有人“借鉴”别人一字差。 各种让人瞠目结舌的科研造假事件让人眼花缭乱、哭笑得, 而现在,学术造假又多了另...

问题 基因家族分析

老师,我在对小麦的某个基因家族进行分析时,这个基因家族的结构域有3种,是分别独立存在的,那我进行分析的时候是3种都分析,还是只需要分析主要的一种?如果是3种都分析,那我是在比对完hmm模型后,是3种分别进行?...