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问题 老师您好,我用MEGA7.0做系统进化树的时候,基因ID中有分号,但是显示,如果在MEGA中修改ID 的话就显示错误。请问应该怎么解决呢

问题 里面说的 amplicon.demo.tar.gz 和 data base . ta ,这两个压缩包,知道怎么下,可以提供一下吗?第一次用这个提问,可能重复提问了,抱歉。

问题 请问在进化树+基因结构+motif+domain的四联图中,为什么domain结构在tbtools上显示出来??以下是我设置的domain文件,请看看有何妥?谢谢

问题 看了perl 语言高级编程课后,对这句脚本理解my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}";请帮忙解释一下,谢谢,特别是这句\\1{".($motiflen/$j-1)."}

问题 您好,我想请教一下如果是十个样品分别用同TMT标记然后混合只进了一针质谱应该怎么用MaxQuant搜库呢,我搜出来的感觉太对,谢谢您。

问题 在基因家族筛过程CD-searcch结果中如果显示结构域N端C端或者NC端完整,这个序列还能留做某一基因家族成员吗

文章 国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”

...。 基因组获取和同源基因筛选 为了实现后续一系列的分析目的,需要获得大熊猫和小熊猫的基因组信息。然而之前小熊猫还没有公开的基因组,而大熊猫的基因组由于公布比较早,质量也够理想。 于是作者对小熊猫基因组...

问题 MEGACC输入的数据应该是比对后的等长度的序列,在megacc里面有-f这个参数是进行序列比对的。。。但我的操作一直错误。。那位大神知道要怎么设置参数

问题 用bwa 进行比对时,用的是重测序的去了接头的clean data 吧,只需要参考基因组的全基因序列吧,需要gff注释 文件之类的吧!

问题 利用FileZIlla上传转录组数据到GEO,为什么用电脑默认的ip地址没问题,用NCBI提供的主机名、账号就连接上服务器,哪位大神可以指点一下

问题 MCSCANX和KAKS计算出的共线性对数目一致,虽然用的都是70%同源性。这合理吗?如果用KAKS计算出的基因对做circos圈图合理吗?

问题 老师好,R包一直安装失败知道怎么回事,Bioconductor上的安装出现问题,如图所示(但是加的话报错!),还有就是VIP还是没通过呀,我子订单也提交了

问题 老师,我在提取gene_exon_info.gff文件提取时运行正常,但是提取的结果完整是为什么?有200多个基因但只提取出来几十个基因的信息

问题 TCGA的RNA-seq count annotation过滤,有些知道是否需要删除

比如 * platform:NA 1. patient_annotation:Observation:General:This subject was duplicated by TCGA-24-0981; 0981 was redacted and this one retained 2. patient_annotation:Notification:Item in special subset:This is part of the ovarian triplet set. 3. aliquot_annotation:CenterNotification...

文章 BWA比对及Samtools提取mapped reads

...ag1和flag2配对的序列分别输出到-1-2指定的文件,对于无法匹配的flag 1/2,全部的flag 0都会保存到-s指定的文件中。 ${ samtools} fastq -n \-1 R1.fq.gz \-2 R2.fq.gz \-s unmapped_singleton.fq.gz \sample_mapped.bam 参考链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/5140942...