...gff <- opt$gff # gff文件pheno <- opt$pheno # 表型数据group <- opt$group # 样本分组信息Chr <- opt$chr # 基因所处的染色体名称start <- opt$start # 基因的起始位置（染色体坐标）end <- opt$end # 基因的...
...是这样的，在进行单倍型分析的时候，利用教程给的demo数据，按照w.sh中的代码一步步操作，能正常分析，非常丝滑，但是我只要换成自己的数据，就会报错“Error in data.frame(Hap = haps, Type = infos) : arguments imply differing number of rows: 1...
...于展示集合（sets）之间的交集关系，特别适合于高维度数据中多重集合交集的可视化。它是传统Venn图和集合图的替代方案，特别在集合数量较多或交集较复杂时，更加清晰和实用。Upset图的应用广泛，常见于生物信息学、统计...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...理后借助液相色谱质谱仪（LS-MS）检测不同样本中代谢物数据信息。LS-MS共检测到18166种代谢物。最后注释到7670种代谢物。之后对代谢物进行聚类分析和PCA分析。（图ac为正离子模式下检测到的代谢物、图bd为负离子模式下检测到...
...种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MAF格式，该软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总，分析，注释和可视化MAF文件. 使用说明： https://www.bioconductor.org/...
老师您好，我的snp数据有两个性状差异比较大的群体，每个群体有30个个体，现在我想算snp-index，问题是测序的时候是单个测序的，也就是说一共测了60个个体的重测序，我想使用BSA类似的方法可是BSA都是要求混池测序，请问怎...
老师： 您好！ 我最近在做玉米基因芯片的数据分析工作。但是我发现芯片文件（GPL.soft）中这些ID都很生僻（如图）,不知如何转换成传统ID？ 貌似那个TIGR ID已经绝版了？我在TIGR ID的对应网站无法下载到对应的转换文件（http:/...
...之后几列分别是颜色、字体、大小以及方向设置。准备好数据后就可以加到进化树中了。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章...
...记者怎么能知道这些事情？！ Excuse me? 李院士，别人数据凿凿，有理有据，知网上一查，是个普通人就知道了，怎么就扯到“科研评估机构”上? 难道你忘了，不知知网的翟博士，就是被某看直播的小伙伴给揪出来了? 《Sci...
...个样本中归一化的数值）。 其实就是WGCNA课程里将分析数据转换成cytoscape绘图文件之前的分析结果都以excel展示了，如何把这些excel结果继续转换成用于cytoscape绘图的文件？ 先谢过各位老师！ 我这些文件里没有基因-基因的对...
...本上所有现有已知物种的序列信息，在进行blast时，由于数据库较大，搜索时间会比较长，同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分，下面以nr库进行举例说明。 一、准备 1.1、数据...