.../2bdd89 延伸阅读：1. 更快更稳地下载NCBI里的测序数据2. 如何高效查找NCBI上感兴趣的公开数据？！3. 如何下载基因组及查找基因4. NCBI-SRA数据提交流程5. qRT-PCR相对定量计算详解6. 绘一棵超酷炫的系统发育树！7.100+篇2019年基因...
...有差异的分子在别人的实验中也有差异，相对来说风险就小一些。 从技术上说，Oncomine的主要功能有基因表达差异分析、基因表达与临床相关性、多基因共表达分析等。 数据挖掘套路： 第一步，查看目标基因在哪些肿瘤中...
...CDS 和GFF文件准备，以及利用python版mcscan工具做物种间的比较分析，组学大讲堂基因家族视频课程中有介绍）。 3. 绘图代码流程 首先，我们需要获取物种间染色体的共线性情况。在进行共线性分析之前，我们先把gff文件转换成...
... 没有NB-ARC.txt 文件，下面所有的步骤都没有办法跟上。如何才能产生一个domain.fa 的文件呢？烦请解答一下哦！顺祝元旦快乐！ # 这是网页中提供的脚本 # 这是课堂里您运行的脚本 #这是个人在bio-linux 运行的！
...或者别的数字，那这样的话，在用cytoscape可视化的时候，如何才能知道哪个node对应的是哪个OTU呢？
run_dbcan \ --out_dir $workdir/6.annotation/CAZy \ --db_dir $Database/CAZy/db/ \ --tools diamond hmmer \ --dia_cpu 40 \ --hmm_cpu 40 \ $workdir/5.pred_cluster/cluster/protein.fa \ protein 如何设置参数
...库更新到最新，silva(138)，greengene(2022_10),ITS(ver9)物种差异比较新增数十种方法：ALDEx2 , DESeq2, edgeR ,limma.voom,metagenomeSeq,LinDA,Maaslin2,Lefser,t.test,ANNOVA等方法，总有一款适合你的数据扩增子分析镜像版本升级，使用一个镜像完成所有分...
生信小白第一次做GWAS分析，有分析过的大神可以讲解一下GWAS这类文章的分析流程吗？听说D-block图会被用上，所以现在正在学习如何做这个图，请问有会做的吗？
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集？ 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量： > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" "F" "G" "H" "I" "J" ##并集 > union(A,B) [1] "A" "B" "C" "D...
代码这个该如何修改
...于对应分析发展而来的一种排序方法，将对应分析与多元回归分析相结合，每一步计算均与环境因子进行回归，又称多元直接梯度分析。 ### 5.1环境因子筛选 有时解释变量（环境因子）太多，我们需要想办法减少解释变量的...
...t")+ ####文字标签和geom_bar的参数position一致，同时调整文字位置vjust=0.5 geom_text(aes(label = dat$Num),position=position_stack(vjust =0.5),size = 5)+ guides(fill = guide_legend(reverse = F))+ theme(plot.title = elemen...
...p备份，置0为不备份，置1，2为备份，但2的备份重要性比1小 第6列设置是否开机的时候使用fsck检验所挂载的磁盘，置0为不检验，置1，2为检验，但置2盘比置1的盘晚检验。 将上面的命令添加进fstab后，为了避免可能的错误，我...
...-1, max = 1) : some entries are not between-1and1 请问老师这一步该如何解决
图1为我研究对象基因组GFF3文件，图2为demo里拟南芥GFF3文件，由于我研究对象的基因组数据只能从NCBI下载，格式问题导致无法运行部分课程脚本，请问老师应该如何解决。