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文章 混池(BSA)定位必看的10个知识点!

...同的亲本杂交后代产生了性状分离都可以拿来做BSA,但是比较常用的群体有:F2、回交群体、重组自交系等。 如果是质量性状,子代的显隐性个体比值可能有1:1、3:1等情况;数量性状的话,子代性状应当符合正态分布为佳,如...

文章 叶绿体基因做跨物种系统发育分析

...进化演变及不同物种间的亲缘关系等具有重要意义。今天编就来介绍如何用叶绿体基因做系统发育分析。 于已测序的物种,我们可以直接下载基因组数据;而没有测序的物种就需要转录组分析数据了。通常是多个物种一起进...

问题 基因家族分析circos时显示基因基因数目超出最大值怎么办

请问出现如上提示如何解决?会影响最后的图吗?我的基因家族间link文件中的基因未完全在最后的图中显示出来 是受到这个的影响吗

文章 组学大讲堂征稿通知

过年回家侄子偷偷和我说“叔叔,你知道吗?我玩抖音都能赚钱!”一脸得意的样子,着实让我批了一顿,好好学习,将来动下笔杆子也比这个赚的多!是呀,有知识还不好赚钱吗?21世纪什么最贵?知识!尤其在这个飞速发...

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 纠错软件-HECIL

...该软件的第一作者居然是来自IBM。 1. 软件的安装 安装比较简单,从github 上下载下来即可。 git clone https://github.com/NDBL/HECIL.git cd HECIL # 设置如下软件和脚本具有可执行权限,这一点非常的重要。 chmod +x bwa samtools Align_Corr.sh ...

文章 植物单细胞转录组文章

单细胞转录组学揭示根组织如何适应土壤胁迫 Zhu, M., Hsu, CW., Peralta Ogorek, L.L. et al. Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress. Nature (2025). https://doi.org/10.1038/s41586-025-08941-z 研究发现,植物根部通过单细胞层面的...

文章 PLoS One好投吗?听说必须要提供WB原始数据?

...,对于广大有硬性论文指标的科研汪来说,还是投PLoS One比较保底? 呵,你以为投PLoS One就一定能中?只能说too naive!! PLoS One:请各位注意,我已经不那么水了! 其实,PLoS One一直算是一个比较有“原则”的期刊,原因有三:...

问题 TCGA数据下载的时侯要有biotype_classs.txt

您好,看了您的视频,获益非浅,但如何创立biotype_classs.txt 这个文件啊?是由这个文件TCGA_CHOL_All_HTSeq_Counts转变而来的么?

问题 circos作图上染色体颜色的设置

...做出来的circos图,第25-33号染色体,颜色都是黑色。这个如何设置呢?颜色一样,这样似乎不太好。我想让这些和其他染色体一样是带不同颜色的。

文章 ActivePerl自带的PPM软件无响应

...,确实使得安装新的模块异常的简单,这里我就介绍一下如何使用PPM(Perl Package Manager)安装模块。 打开PPM,我们看到的界面是这样的,但是有时候PPM长时间无响应,无法安装包: 这时候我们可以换一种安装perl模块的方法,...

问题 具有两个结构域的基因家族的分析

...起来继续分析,还是分别分析再合并,如果是前者的话改如何合并,后者的话分析到哪个步骤再合并,文献中说的都不清楚

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...。 方差分析最简单的形式就是单因素方差分析,在这里编就为大家介绍使用Excel 2010软件进行单因素方差分析的方法。 注意事项 在使用Excel进行方差分析前,需要确定“工具栏”是否安装了“分析工具库”,若没有安装,则...

文章 好用的perl模块推荐

...dir path unless(-d path); 来创建目录,他虽然方便,但是毕竟比较长,而且无法创建多级,所以如果脚本里有很多目录要创建,可以使用以下的代码 use Path::Tiny;path("path/to/your")->mkpath; 删除也同样有很多功能可以高效化你的脚本...

文章 Plant Communications | 浙大团队解析比克氏棉全基因组进化规律及其色素腺体和棉酚形成机制

...的祖先种为父本通过杂交进化而来。此外,该研究还通过比较转录组学分析并结合VIGS验证,挖掘出一个与棉酚合成相关的细胞色素P450基因GbiCYP76B6,沉默该基因后使比克氏棉棉酚含量显著下降,且该基因受腺体形成转录因子GoPGF...

文章 两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!

...择好树形后,如果觉得还不够美观,我们可以对树枝进行调整(我们拿环状进化树进行后续演示),在左测一列中勾选Tree-Transform branches,有三类树枝类型equal、cladogram、proportional,选中你要的树枝类型。显示树根就在绿色框的Sh...