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问题 导入的过程,遇到了这个错误,卸载了再弄也是这样,请老师帮忙解答一下,谢谢。

问题 Tassel进行自己的GWAS分析,自动分析pca时,不生成pca1~3文件

问题 蛋白质组学文章差异倍数选择相差很大,有没有一个标准?

经常看蛋白质组学相关的文献发现里面选择的差异倍数经常有1.2倍,1.3倍,1.5倍,2倍的,这有没有一个统一的标准,有相关文献吗?

问题 dadi 分析根据基因组创建annovar库出现报错

[root@30b37d57431e  00:02:31 /work/3.map/dadi]# gtfToGenePred -genePredExt /work/ref/Bamboo.Hic.gtf  unknown_refGene.txt conflicting frame for PH02Gene38416.t1 exon index 0, was 0, trying to assign 2

问题 docker 启动报错&容器进程终止

...ould not find any running process: no such process  以及前期在docker进行进化树构建时,进程经常自动止(docker 创建时指定了最大使内存为96g)(需要建树的序列有96条)命令为 iqtree2 -s aligned_trimed.fa -mem 96G -m MFP -B 1000 --bnni -T AUTO -...

问题 请问GWAS分析的D-block图有人会做吗?

生信小白第一次做GWAS分析,有分析过的大神可以讲解一下GWAS这类文章的分析流程吗?听说D-block图会被上,所以现在正在学习如何做这个图,请问有会做的吗?

问题 基因家族分析时,顺式作元件提取只能提取列表的一部分基因,请问是什么原因

请问老师,这是什么原因?

问题 老师您好,我按照课程提供的流程泡自己的数据,在fst pi tajimaD分析的过程,发现生成的曼哈顿图没有数据,在第一步的过程,我们确实成功的生成了染色体对应的起始位置和pi值,但在pi多样性绘图输出时却发现没有数据,这是怎么回事呢,请老师帮忙解决

...pi -F $FAI -f 42350435 -n pi.JR.wild,我是根据自己的参考基因组染色体的最小值来进行筛选的最小值:42350435。 但是这样生成的曼哈顿图还是没有数据,

问题 公司的结题报告,出现一个lncRNA有多种外显子情况

老师,您好。最近在做lncRNA分析,看了公司的结题报告,出现一个lncRNA转录本对应多种外显子个数的情况。 比如lncRNA1,有1个外显子,也有5个外显子的情况,就很困惑,他到底是有1个还是5个? 请问,这是为什么呢? 谢谢!

问题 动植物基因组组装课,脚本文件sed命令的含义

注释部分,01.Repeat.sh脚本文件84行: #修改分类名字 sed -i '/>/s$\s.*$#DNA/MITE$' MITE.lib 这里sed是了替换的功能吗?sed替换的格式:sed 's/原字符串/替换字符串/',这句命令的s后面没有“/”。

文章 解决Rdevtools安装github软件包遇到“SSL connect error”的问题

Rdevtools 安装github的R软件包,遇到“ SSL connect error” 问题。 > devtools::install_github("bartongroup/proteusLabelFree") Downloading GitHub repo bartongroup/proteusLabelFree@master from URL https://api.github.com/repos/bartongroup/proteusLabelFree/zipball/master Er...

问题 WGCNA分析,灰色模块基因数若过多是说明划分模块有问题么?

我有100多个样品,选择5万左右的基因进行WGCNA分析,软阈值选择后符合R平方大于0.8,采blockwise方法划分模块,但是最后发现有近一半的基因属于灰色模块。这正常么?能说明什么问题

问题 TbtoolQuick Mscanx Wrapper使的时候总是得不到结果

我按照简书上的基因家族分析步骤,分析两个物种的共线性。已经得到了merge的blast结果和gff结果,使Quick Mscanx Wrapper的时候总是得不到结果,只能得到两个merge之的文件的副本。这是结果和参数图。

问题 在GEO分析遇见的问题

...了一个问题:表达数据(GSE27856expressionMatrix.csv)与课程生成的人类的数据(GSE66597expressionMatrix.csv)相差很大。人类的基因表达结果一般只有个位数,而水稻基因表达有的高达上千位数(请看图)!(特别说明:所有操作都是...

问题 请问在MEGA7.0出现这种问题该怎么解决? No common sites found

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