...，确实使得安装新的模块异常的简单，这里我就介绍一下如何使用PPM(Perl Package Manager)安装模块。 打开PPM，我们看到的界面是这样的，但是有时候PPM长时间无响应，无法安装包： 这时候我们可以换一种安装perl模块的方法，...
...进化演变及不同物种间的亲缘关系等具有重要意义。今天小编就来介绍如何用叶绿体基因做系统发育分析。 于已测序的物种，我们可以直接下载基因组数据；而没有测序的物种就需要转录组分析数据了。通常是多个物种一起进...
过年回家小侄子偷偷和我说“叔叔，你知道吗？我玩抖音都能赚钱！”一脸得意的样子，着实让我批了一顿，好好学习，将来动下笔杆子也比这个赚的多！是呀，有知识还不好赚钱吗？21世纪什么最贵？知识！尤其在这个飞速发...
...择好树形后，如果觉得还不够美观，我们可以对树枝进行调整（我们拿环状进化树进行后续演示），在左测一列中勾选Tree-Transform branches，有三类树枝类型equal、cladogram、proportional，选中你要的树枝类型。显示树根就在绿色框的Sh...
...起来继续分析，还是分别分析再合并，如果是前者的话改如何合并，后者的话分析到哪个步骤再合并，文献中说的都不清楚
aggregate这个函数的功能比较强大，它首先将数据进行分组（按行），然后对每一组数据进行函数统计，根据数据对象不同它有三种用法，分别应用于数据框（data.frame）、公式（formula）和时间序列（ts）： aggregate(x, by, FUN, ..., si...
... 没有NB-ARC.txt 文件，下面所有的步骤都没有办法跟上。如何才能产生一个domain.fa 的文件呢？烦请解答一下哦！顺祝元旦快乐！ # 这是网页中提供的脚本 # 这是课堂里您运行的脚本 #这是个人在bio-linux 运行的！
...或者别的数字，那这样的话，在用cytoscape可视化的时候，如何才能知道哪个node对应的是哪个OTU呢？
run_dbcan \ --out_dir $workdir/6.annotation/CAZy \ --db_dir $Database/CAZy/db/ \ --tools diamond hmmer \ --dia_cpu 40 \ --hmm_cpu 40 \ $workdir/5.pred_cluster/cluster/protein.fa \ protein 如何设置参数
...icle?id=11097该阈值选择来自于GATK4官网的推荐，阈值依据于比较真 vs. 假 snp的特征值（annotation values）统计分布 One of the most helpful ways to approach hard-filtering is to visualize the distribution of annotation values for a truth set called using a particular p...
...0291076 延伸阅读：1. 更快更稳地下载NCBI里的测序数据2. 如何高效查找NCBI上感兴趣的公开数据？！3. 如何下载基因组及查找基因4. NCBI-SRA数据提交流程5. qRT-PCR相对定量计算详解6. 绘一棵超酷炫的系统发育树！7.100+篇2019年基因...
生信小白第一次做GWAS分析，有分析过的大神可以讲解一下GWAS这类文章的分析流程吗？听说D-block图会被用上，所以现在正在学习如何做这个图，请问有会做的吗？
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集？ 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量： > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" "F" "G" "H" "I" "J" ##并集 > union(A,B) [1] "A" "B" "C" "D...
...有差异的分子在别人的实验中也有差异，相对来说风险就小一些。 从技术上说，Oncomine的主要功能有基因表达差异分析、基因表达与临床相关性、多基因共表达分析等。 数据挖掘套路： 第一步，查看目标基因在哪些肿瘤中...
代码这个该如何修改