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文章 解读：2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息？

...“高被引科学家”名单，在这份名单中，涵盖了全球近60个国家的6216人次的高被引科学家。我们先一起来看看全球排名前10的名单：图：来源于科睿唯安现在问题来了，到底什么是“高被引科学家”?简而言之，就是这些科学家们...

问题 请问下jupyter notebook运行一个不到5M(20万行左右)的文件，内存持续飙升，随后浏览器闪退该怎么解决？

...的程序界面。目前已做了更换了浏览器处理（由原来的edge换为了google浏览器，依然无果），目前电脑配置算是良好，内存16G, amd，i7处理器，win11系统，联想笔记本R9000X 2021R。

文章 VennDiagram各区域信息提取

...是进行Venn图绘制的 R包，最多能够绘制五组数据，其中一个主要的绘图函数为venn.diagram() 针对该参数相关的参数调整，可以直接对Venn图的颜色字体等多主题进行修改。而其绘图数据，也就是venn.diagram() 对应的数据是一个list向量...

文章 arrow 安装失败可

CMake Error at utf8proc_ep-stamp/utf8proc_ep-download-RELEASE-impl.cmake:9 (message): Command failed (1): '/usr/local/bin/cmake' '-P' '/tmp/Rtmp2YramV/filec14344f44c6c/utf8proc_ep-prefix/src/utf8proc_ep-stamp/download-utf8proc_ep.cmake' CMake Error at utf8proc_ep-stamp/utf8proc_ep-downl...

文章 ssh-keygen和ssh-copy-id实现免密登录远程主机

...甚至有的应用部署也必须要免密登录远程主机，例如hadoop环境搭建。 免密登录，需要先在本机生成公钥，然后将公钥拷贝到远程主机，拷贝的过程，既可以手动（在远程主机根目录下创建.ssh目录，然后将公钥存入该目录下author...

问题 单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后报错

...速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后（Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \  -p FindAllMarkers --test.use  DESeq2   --logfc.threshold 0.25 ）报错，想请教老师是哪里出现了问题，应该怎...

问题 单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后报错

...速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后（Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \  -p FindAllMarkers --test.use  DESeq2   --logfc.threshold 0.25 ）报错，想请教老师是哪里出现了问题，应该怎...

文章 Docker 使用容器来创建更新镜像

...it 命令：$ exit $ docker commit eafd9111ada6 omicsclass/rnaseq:v1.1.1 b1829eb2e483c9d353dd8cd21da9bf2f530bd38ccf5a95e08944a887ec856e99命令中，指定了要提交的修改过的容器的ID、目标镜像仓库、镜像名。commit提交的知识创建容器的镜像与容器的当前状态之...

文章 Unicycler二代、三代混合组装

一、下载、安装Unicycler 地址：https://github.com/rrwick/Unicycler 使用git安装或者源码安装 git clone https://github.com/rrwick/Unicycler.gitcd Unicyclermake 注意：需要自行安装依赖软件：spades、racon、pilon、bowtie2、blast、samtools、java、bcftools 二...

问题 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

建树命令：iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree 出现了下面这个警告，说我的文件中含有蛋白序列可是我的文件是使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件的，里面是应该只包含蛋白序列的我疑...

文章 手把手教你在线分析转录因子结合调控分析（植物）

今天介绍一个植物的转录因子调控的综合性分析网站PlantRegMap，该网站的功能非常的强大，其主要功能包括如下： 1. 植物转录因子预测     输入蛋白序列或者核酸序列即可对是否是转录因子进行预测，如果是转录因子，会对...

文章 MarkDuplicates (GATK)报错：打开的文件句柄过多(Too many open files)

使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了： 理解了一下应该是程序在读取运行中间文件的时候，超过了Linux操作系统允许的用户IO读取范围，所以查看了一下Linux对于当前用户读取文件数量的软限制： 发现进程最大允...

文章 PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc

...： 如果是名字中存在"/"，采用sed修改即可 sed -i "s/\//-/g" fa文件

文章 细胞长不好？那是你没选对细胞因子！

...术中最核心，最基础的技术，而细胞因子的添加，则是整个细胞培养过程中的重要环节，如何选择正确、优质、可靠的细胞因子对后续实验，如肿瘤、免疫、干细胞等相关研究都至关重要。 特别是如今干细胞治疗、CAR-T细胞治...

文章 当代博士的真实困境：秃头、延毕、论文难发、母胎单身......

首先请看： “一个对延毕一年没有信心以至于想要“连续包年”的博士生↓↓↓” 图：来源于微博@PITD亚洲虐待博士组织 博士们有多难? 本来只想安安静静地拿个学位，没想到还没毕业，就已被虐的遍体鳞伤...... 读博的辛...