老师您好，我想做某个物种的基因组组装，但是这个物种有野生种、栽培种和地方种，并且这些品种还分不同地区的，例如不同地区的野生种，请问我该如何选择呢？选择的依据是什么？
...的结果，基因名称不是我原本的名称，且序列比对结果也比较乱，不知道为什么？ 我输入的ALN文件格式如下： ath-miR156g ---CGACAGAAGAGAGUGAGCAC--- mdm-miR156e ----GACAGAAGAGAGUGAGCAC--- cca-miR156k ----GACAGAAGAGAGUGAGC...
您好，在OmicsClass上看到您讲的关于如何使用BinGO的文章，但是我从它的官网上没有找到我所做物种的注释文件，这个注释文件是什么样子的，我现在有我们所做物种的基因ID所对应的GO号的文件，但是这个软件好像不能识别。想...
我用这个代码是他的前一步不报错，但是这一步报错，代表我的分组信息这些都是准确的 这个代码不报错 for i in {2..6};do Rscript $scriptdir/meta_stat.r -i ../05.export_data/taxa_summary/absolute_abundance/feature_table_tax_L$i.txt \ -m $metadata -...
老师，用R语言如何对转录组差异基因进行k-means聚类分析，出那种折线图。我在网上百度到的Tcseq包等都是时序的，我的数据是分样本不涉及时序，不知道该怎么做k-means分析的折线图，求助。
RStudio跑代码时报错，出现“无法分配大小为7.4 Mb的矢量”，释放内存等方法都试过了，如何解决
老师好，在进行基因家族分析时，运行保留蛋白编码基因的脚本，运行过程正常，没有报错，但最后得到的文件却是空的，请问这是什么原因呢？如何解决呢？
通过CNVnator获得的CNV文件，再通过SURVIVOR merge合并获得的VCF格式文件，如何做群体的进化树分析和群体结构，用mega软件的邻接法做不出来。最后问下可以做选择性清除Fst和Pi θπ分析 Tajima's D分析
...at clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP，那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢？在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总数不一致，那SNP总数应该...
在mac上用qiime2调用dada2报错 在mac上使用qiime2调用dada2报错，请问老师如何解决？
...达和下调表达的将分开显示，其中第一页一般显示Top25，调整页面数，可以显示其他结果，同时使用者可以选择不同的图片保存格式（见下图）。 目标基因深度挖掘 在经过数据的初步分析和相关筛选之后，针对筛选出的目标...
...产生的中间变量，还需要在shell中继续处理。 一、那如何在awk中使用在shell中定义的变量呢？ 方法一：使用"'把shell变量包起来，即"'$var'"；注意是“双引号+单引号+shell变量+单引号+双引号”的格式。 这种写法大家无需改...
...的查询 3. 支持数据下载 在线查询，针对少量的miRNA，比较方便，但是如果要想对批量的miRNA进行分析，还是最好能将数据下载到本地进行分析，该数据库支持数据的下载，非常的方便。 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，...
...下，直接按照runinfo 信息下载的数据的格式是什么格式？如何转化为fastq格式？ 如下面的下载地址：https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos2/sra-pub-run-11/SRR1218151/SRR1218151.1
...E149614 count表格输入)：https://www.omicsclass.com/article/2513 非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465 indrop数据) ： https://www.omicsclass.com/article/2515 非小细胞肺癌 （GSE139555 10X 多样本批量）:https://www.omicsclass.com/article/2532 结直肠癌 CRC(GSE146771 s...