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问题 老师好,请问课程bsa分析,mutmap能同时输入两个子代混池吗?

文章 2区SCI赏析—木麻黄MYB基因家族鉴定及其在盐胁迫的响应

...章,看看它是如何发到2区期刊的。 文章简介 MYB是植物最大的转录因子家族之一,是一类能与真核基因启动子区域特异性相互作的DNA结合蛋白,MYB转录因子通过彼此之间或与其他相关蛋白之间的相互作调控基因的表达。M...

问题 您好,在NR数据库本地化的教程,在运行perl脚本之后,内容为 unknown gi

您好,在NR数据库本地化的教程,在运行perl脚本之后,内容为   unknown gi    请问有什么解决办法吗

文章 perl 批量创建不同的文件,于文件批量分隔成小文件

..." or die "$!";} #批量创建文件,把创建的文件句柄放到,hash存储; my%fout=();for my$i (1..10){my $f=FileHandle->new("> ${i}_links.txt");$fout{$i}=$f;} #根据不同的条件输出到不同的文件当 while(<IN>){my@tmp=split(/\t/);print $fout{$tmp[0]}  $_;}

问题 单细胞测序高级分析RNA速率分析的重复序列怎么生成

如图所示,这个文件怎么去生成,研究的物种并不是小鼠和人的,是一个比较小众的物

文章 从技术雷达看​DevOps的十年——容器技术和微服务

... 时代,DevOps 所有的实践都围绕着 Docker 展开,以 Docker 为心的技术架构影响了软件开发交付的方方面面。无论是开发还是运维都在讨论和使 Docker。它们采统一的交付格式和技术语言在讨论交付的过程,而不像之前开发只...

问题 我在使SSR引物设计时,使课程视频里面的脚本和示例文件,跑出来的结果文件里面是空的,提示好像是路径的问题?

不了图,我粘一下文字,最后提示好像是路径的问题?我反复对比视频内容发现视频里的镜像omicsclass/reseq是8.76G,目前镜像更新后的版本是13.8G,会不会是镜像更新后出现了Bug,希望能够得到解答,错误提示在文字最后面。 SEQU...

问题 老师您好,我现在正在做500人样本的宏基因组分析,将其分成三组,目的是为了找出三组之间的差异性菌群及菌群功能分析,现在遇到了一些问题,详情如下,我已经完成了宏基因组分析的绝大部分流程,物种丰度也完成了,现在已经salmon识别了基因,得到了基因丰度,接下来的一步就是要比对基因名称和功能,请问具体怎么执行操作,我不是很懂,谢谢老师

问题 动植物比较基因组分析实操基因组的版本信息

动植物比较基因组分析实操使物种基因组的版本信息是什么??论文写作的时候,需要提供这些版本信息和引发表的论文。1.Vitis_vinifera, 2.Theobroma_cacao,3.Solanum_lycopersicum, 4.Papaver_somniferum,5.Oryza_sativa,6.Nelumbo_nucifera,7....

文章 GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

...85%致病突变,与个体表型相关的大部分功能性变异也都集在染色体的外显子区。能够识别单核苷酸变异体(SNVs)、小插入缺失(InDels)以及能够解释复杂遗传疾病的罕见的原发性突变。 本篇文章只是分享一下利肿瘤外显子体...

文章 Linux 服务器 安装Jupyter notebook 并开启远程访问

...配置文件jupyter notebook --generate-config 2. 创建密码使python的passwd()创建密码,终端输入ipython打开ipython并输入:In [1]: from notebook.auth import passwd In [2]: passwd() Enter password: ****** Verify password: ****** Out [2]: 'sha1:...' 复制Out [2] 显示的密码...

文章 IF=4.9 | 多倍体割手密IAA基因家族分析鉴定

...素反应等方面至关重要。割手密(Saccharum spontaneum) 基因组鉴定出92个IAA家族成员,分布在32条(4n)染色体上,并基于系统发育和motif分为三个组,进行基因家族扩张分析。通过顺式作元件预测了参与植物激素调节和应激反应...

文章 R语言按列合并文件,并保持其一个文件的原有顺序

...对该列的顺序重新排序,即对rowname重新排序 在实际操作,有时候我们需要根据某一文件的顺序生成文件,merge函数无法实现 举个例子: # 数学成绩math <- data.frame(name=c("小明","小红","小亮","小欣"),math=c(76,84,64,88))# 英语成...

文章 pfam数据库介绍及使

一个基因转录的蛋白质分子可以包含多个结构特异并且功能不同的区域,这些区域称之为domain,domain 可以看作蛋白质功能的基本单位,蛋白质的功能由包含的多个domain共同决定,研究domain, 可以更好的研究蛋白质功能,而具有...

问题 BSA分析ED法和SNP-index的方法,哪个更加准确一些?