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问题 基因家族成员数

...族各成员的多条转录本序列,我们在构建系统发育树时该如何选择?我看那篇nbs鉴定的原文在鉴定完之后还要根据功能注释手动删除,如果是按照功能注释选择,该怎么实现?

问题 TCGA下载数据更改了工作目录

各位老师:TCGA下载数据下载了一半,又改了另外一个工作目录,结果出现下面信息,如何解决?谢谢了!

问题 重复序列注释问题

...at.sh 脚本时如果中间报错,例如未找到某个文件的时候,如何查看是哪一步出错,哪些运行成功了,从而从报错的命令之后运行?

问题 GEO数据标准化问题

自己找了很多序列但是没有一个能像视频课讲解的案例的方式标准化处理,请问老师这些该如何标准化并分析?序列.docx

文章 使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

...到一个收敛的结果,如果1000次计算还是不能收敛,需要调整隐藏因子的数量 iteration 0/1000 iteration 1/1000 iteration 2/1000 iteration 3/1000 iteration 4/1000 iteration 5/1000 iteration 6/1000 iteration 7/1000...

问题 GO富集二级分类柱状图和显著性气泡图的问题

...呈现的。有的条目上富集的基因特别多,但是P值或者Q值比较大,达到0.99,选择气泡图时并不能体现出来。若选择以分类柱状图来体现时,就相当于没有考虑P值的情况,这个时候您觉得是柱状图还是气泡图更能说明GO富集情况代...

文章 详细教程:慢病毒包装详细实验步骤是怎么的?

...因此慢病毒的包装也慢慢越来越火,成为目前各大实验室比较普遍的实验之一,然而,有不少科研伙伴表示,慢病毒的包装实验步骤实在是太复杂啦,伤不起! 下面,学霸姐姐就为大家详细介绍一下慢病毒包装实验的步骤以及...

问题 基因家族成员命名

...有其他研究者研究过并对其命名的话,在文章中,我应该如何命名这些基因?

问题 kaks计算过程问题

您好,我们采用了aln2axt.pl脚本运行,但运行得到的axt文件仍然不equal,我们检查了我们序列的长度,序列比对总长度是3的整倍数.序列都含有起始密码子ATG,请问一下如何解决呢?

问题 一个酶基因家族里边具有两个结构域

蔗糖合酶基因家族里边,同时具有两个结构域,这个脚本该如何变啊

问题 GSDS展示图中想修改下基因名称

如何在GSDS中修改下基因名称呢,是修改gff文件吗,这是文件

文章 metascape数据库

...供最准确的结果。因此Metascape数据库可以作为富集分析的比较好的手段。 metascape:https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1 step1:粘贴基因列表或者是上传基因文件 step2:设置物种 Step3:点Express Analysis 默认的Express Analysis会把...

文章 agilent表达谱芯片注释信息提取

1、GEO数据库中  agilent表达谱芯片由与其设计往往比较个性化,涉及的芯片型号很多,使用的Cy5/Cy3的双色芯片 或者仅使用Cy3的单色芯片,数据上比较混乱,而GEO中提供的GPL信息文件格式和affymetrix  、illumina 的表达谱芯片对应的G...

文章 细胞长不好?那是你没选对细胞因子!

...细胞因子的添加,则是整个细胞培养过程中的重要环节,如何选择正确、优质、可靠的细胞因子对后续实验,如肿瘤、免疫、干细胞等相关研究都至关重要。 特别是如今干细胞治疗、CAR-T细胞治疗等领域非常火热,对细胞因子...

问题 泛基因家族分析核心基因的确定

我在根据直播课程学习泛基因家族分析。请问老师如何确定核心基因等。如玉米TPS家族鉴定的这篇文章。