老师你好,我想问下做WGCNA分析的时候,我的样本信息特征是处理时间不一样,请问cor相关系数该选择("pearson", "kendall", "spearman")哪一个?
...m -rf /var/lib/dockershim# rm -rf /var/lib/docker 如果发现删除不掉,需要先 umount,如 # umount /var/lib/docker/devicemapper 6. 卸载 docker 查看已安装的 docker 包 # yum list installed | grep docker 卸载相关包 # yum remove docker-engine docker...
...-Linux是功能齐全的、强大的、可定制的、易于维护的生物分析工作站。Bio-Linux基于Ubuntu提供500多个生物分析程序,由一个 图形化的菜单进行管理,能方便地访问到其生物分析文档系统及对测试程序有用的样本数据。用于处理新...
...ld tolerance in Prunus salicina × armeniaca”的转录组-代谢组联合分析文章。” 01 — 研究背景 杏黄李(Prunus salicina × armeniaca)是李与杏的种间杂交果树,兼具优良风味与经济价值,主栽于中国新疆等冬季严寒地区。频繁的极端低...
...加sudo权限 首先需要切换到root, su - (注意有- ,这和su是不同的,在用命令"su"的时候只是切换到root,但没有把root的环境变量传过去,还是当前用乎的环境变量,用"su -"命令将环境变量也一起带过去,就象和root登录一样)chmod u+w /e...
言不如表,表不如图,一图胜千言。见多了散点图,柱形图,折线图等这类代表数值大小及变化趋势的图。今天给大家介绍一类代表包含关系的图,那就是韦恩图。 韦恩图(Venn diagram) 又称为文氏图,是关系型图表,通过图形...
...包且对包能够进行管理,同时对环境可以统一管理的发行版本。Anaconda包含了conda、Python在内的超过180个科学包及其依赖项。 其包含的科学包包括:conda, numpy, scipy, ipython , jupyter notebook等等,因此安装anaconda一些常用的包就一并...
请问做完蛋白质全长多序列比对分析后用genedoc画图时显示我的基因家族结构域WRKY好像不太保守,有什么方法能改进吗,还是这个已经可以了?
... 首先小编简单介绍下这篇被二次挖掘多次的单细胞数据分析的原文,这篇文章的主要内容如下: 作者选取了10个肝癌病人共21个样本,取样类型包括:primary tumor (T)、portal vein tumor thrombus (P)、metastatic lymph node (L)、non-tumor liver (N...
老师您好,请问下:基因家族成员中某一成员的蛋白序列起始氨基酸不是甲硫氨酸,请问下这样的成员还要列入该家族中吗?是不是不需要将该基因进行后续分析了? 谢谢老师的解答
做毕业设计:在对比分析完开始建树会出现下面图片的错误,对比了7个物种的同一个酶的基因,我自己实在不知道咋办,6条序列是ncbi下载的,有一条是测序序列,非常感谢
在我们的《TCGA差异表达分析》课程中,我们介绍了采用TCGAbiolinks 去下载GDC上的TCGA数据。但是最近有学员想基于“Primary Site” 筛选一下样本,只对其中的一种类型进行分析。 如下图所示: 我查看了一下TCGAbiolinks的文档,发现...
...是v22,现在文章用的也都不一样,不懂这些差距对于后续分析的影响大吗。 然后我用R提取了v28的ensemble ID ,gene symbol 和biotyoe。 lncRNA是没问题的,都能正常与老师提供的对应上 对于mRNA的信息有点出入,不知道如何择选的,因...
...lity-check QUALITY_CHECK 选择CheckM版本,默认`checkm`,可指定`checkm2`,例如: `-qc checkm2`用于质量检查。 --min-cpn MIN_COMPLETENESS 过滤保留bin的最小...