问题 筛选不到串联重复基因

老师您好，根据基因家族课程中共线性分析后的操作我没有筛选到大豆中一个基因家族的重复序列，请问是我操作有问题还是没有串联重复序列也是正常的呢？谢谢老师解答

问题 GWAS分析筛选关联区域

在筛选GWAS关联区域内的基因时，基因或者SNP与选定的显著关联区域有百分之多少的交集可以定义为关联区域内的基因或者SNP

问题 老师您好，我想问下如何用hmmsearch在数据库中搜索同时具有两个结构域的所有蛋白质

...构域B，这个蛋白具有重要的生理功能，那么能用hmmsearch搜索同时兼具这两个结构域的所有蛋白质吗，我尝试了用hmmsearch分别搜索具有结构域A的蛋白质和具有结构域B的蛋白质，然后对得到的文件求交集，但是失败了。

文章 实验研究中的肿瘤细胞从哪来?肿瘤细胞详解

...985年之后以NCI为首的一些研究单位普遍开始放弃体内小鼠筛选，代之为体外的人类各种常见实体瘤肿瘤细胞株筛选。因此，肿瘤细胞作为一种高通量的抗肿瘤筛选体系，成为不可或缺的研究工具，下面我们就一起看看实验室的肿...

文章 筛选VCF中指定位置变异位点

...       --vcf    后面跟的是vcf文件     --chr    后面跟筛选区域所在的染色体     --form-bp    后跟筛选区域的起始位置     --to-bp        后跟筛选区域的终止位置     --out    输出文件的前缀     --recode    没有此参...

问题 hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错，请问老师什么原因

问题 hmmer搜索结构域

想修改WRKY_hmmerOut_final.txt中结构域的18、19列也就是结构域起始、终止位置，不知道具体在哪一列，还有上一次默认做出来的图中发现后面普遍锌指结构不全，应该是要整体后移以下，如图：，结构域缺失较多的基因，CDD数据库中...

问题 搜索不到组学大课堂的镜像

[chenzhaojin@lfpara ~]$ curl -s https://hub.docker.com/v2/repositories/omicsclass/genome-annotation/ [chenzhaojin@lfpara ~]$ docker search omicsclass NAME                                                DESCRIPTION                                     STARS...

问题 “linux文件的查看以及搜索使用技巧以及cut命令”课程讲解所用文件“gene 2019”如何索取

在“linux文件的查看以及搜索使用技巧以及cut命令”课程中使用的文件，课程下载资料里没有提供，请问从哪里可以获取？

问题 WGCNA如何进一步筛选基因

课程里面讲cytoscape绘图那一部分的时候，在原来得到的文件的基础上筛选出了前三百的基因，这个具体该怎么筛选？

问题 想问问老师和大家，blast搜索鉴定之后如何提取对应的domain呢

问题 我看好多hsp20基因都是多个物种进行多序列比对的，多个物种比对那个蛋白质序列都需要筛选吗，构建进化树的时候，每个物种都需要筛选吗

问题 如何TajimaD筛选选择区域内的受选择基因的问题

老师，您好，请问脚本绘制完Tajimad之后，生成了一个TajimaD.smoothline_data.txt文件，但是并不像之前有筛选好的top5%或者1%，脚本里是不是没有加上？那么我们怎么筛选，可以根据这个文档手动排序吗？

问题 数据筛选

一个基因有多个 isoform蛋白 建树时是否要都放进去

话题 数据筛选