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文章 stack的利

Python可以使栈(stack)数据结构来分析数据。下面是一个使栈来判断一个字符串的括号是否匹配的例子: def is_matching_parentheses(string): stack = [] for char in string: if char == '(': stack.append(char) elif char ...

文章 kraken2生成的biom文件处理

...不使bracken则可能会遇到一个问题,结果生成的biom文件taxonomy并不是最终结果,比如下面这样 可以脚本来处理,删除未具体命名的分类级别 import argparse from biom import load_table, Table import numpy as np def main(): # Parse command-l...

文章 【Linux】查看文件的某几行(间几行)

...行。 3、grep命令 grep -C 5 Error filename  # 显示file文件匹配Error字符串那行以及上下5行 grep -B 5 Error filename  # 显示Error及前5行 grep -A 5 Error filename  # 显示Error及后5行

问题 无参转录组结果为什么好多unigene下有多个CDS序列呢?

问题 请问,TCGA数据库下载的数据如何区分癌组织和癌旁呢?

问题 如何从种类繁多的GO和KEGG富集条目找到自己关注的?

问题 BSR-seq 结果的曼哈顿图怎么看?

请问老师从曼哈顿图怎么确定阈值区间?这个图是否可以确定候选染色体?

问题 老师好,请问课程bsa分析,mutmap能同时输入两个子代混池吗?

问题 您好,在NR数据库本地化的教程,在运行perl脚本之后,内容为 unknown gi

您好,在NR数据库本地化的教程,在运行perl脚本之后,内容为   unknown gi    请问有什么解决办法吗

问题 单细胞测序高级分析RNA速率分析的重复序列怎么生成

如图所示,这个文件怎么去生成,研究的物种并不是小鼠和人的,是一个比较小众的物

文章 perl 批量创建不同的文件,于文件批量分隔成小文件

..." or die "$!";} #批量创建文件,把创建的文件句柄放到,hash存储; my%fout=();for my$i (1..10){my $f=FileHandle->new("> ${i}_links.txt");$fout{$i}=$f;} #根据不同的条件输出到不同的文件当 while(<IN>){my@tmp=split(/\t/);print $fout{$tmp[0]}  $_;}

文章 iTOL绘制好看的系统发育树

...种和基因等,在系统发育分析、基因家族和物种进化分析经常会看到此类图片。 像这个 还有这个 是不是很漂亮?你的呢?还是像这个吗? 想要让你的图也像别人的那样漂亮吗? 来,我给你推荐一款强大好的在线...

文章 进生物实验室之前,这本生存指南请拿好!

...操作,永远是——请努力的活下来! 没错,在实验室,安全问题永远是首要的问题。 自我标榜再安全的实验室,也总会因为一些莫名其妙的安全隐患出些岔子。 当你在实验室里做着实验唱着歌,忽然这里发生一下爆炸,...

问题 动植物比较基因组分析实操基因组的版本信息

动植物比较基因组分析实操使物种基因组的版本信息是什么??论文写作的时候,需要提供这些版本信息和引发表的论文。1.Vitis_vinifera, 2.Theobroma_cacao,3.Solanum_lycopersicum, 4.Papaver_somniferum,5.Oryza_sativa,6.Nelumbo_nucifera,7....

问题 想问一下做药物作后的itraq标记质谱分析蛋白的变化?对照组是113和114,实验组是115,116,117,那如果得到了115/113,116/113,117/113,115/114,116/114,117/114这些都是实验组与对照组倍数变化fold change 以及他们对应的p值,那我怎么,筛选的时候要这六个比值的均值吗?还是有其他的筛选办法?还有六个p值应该如何来筛选?