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问题 文献检索

请问如何找到关于淮稻5号基因组的遗传图、物理图和测序的相关信息的文献?

文章 数据分析代码2__用法

...代码,得到结果 后者使用ex调用,功能复杂一点,用法比较多不一一距离,常用于丰度估计 比如一个物种分类表然后我有名称对应的丰度表,比如显示不全,看着不对应,实际上是几万行相互对应的,我现在想知道每个分...

文章 单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体

...正常:心肌等耗能较多的地方,线粒体基因含量也可能会比较高 人:^MT- 鼠:^mt- 检测是否存在血红蛋白污染 人:^HB[^PES] 鼠:^Hb[^pes] 核糖体污染 人:^RP[SL]  鼠:^Rp[sl] 一般情况下,鼠的相关基因的名称是...

问题 qPCR问题

老师您好,我想问一下,Qpcr交叉点如何定义?交叉点是阈值吗?有没有固定的定义?

问题 果实发育时期的转录组热图中,有几个基因在各个时期均表现低FPKM值,请问是转录组数据有误吗?

...中,自上数第2-5个条带,分别是4个基因,FPKM 都在在0-2的数值,表现为基本不表达。 请问这种情况,有什么可能原因呢,是由于转录组数据有误、或是基因有误吗?我该怎样检查呢? 请老师指导!

问题 代码报错

这个代码报错我看不懂,请问老师这个要如何解决呀,我用的是自己下载的昂飞芯片数据

问题 基因组注释

选择性清除结果Fst如何注释?Ensemble万丈迟迟打不开

问题 mega使用时出错

请问这是什么原因,该如何解决?谢谢!

问题 VCF文件

vcf格式文件中REF列全部是N,如何将其替换为与参考基因组文件一致的碱基

文章 excel批量去除单元格中的换行符

有人使用Excel时会不心在单元格最后加个换行符,如果比较少,可以直接删掉,但是如果较多,一个个删就会很费劲。 这里有一种快速解决的方法。 1、选择要替换的单元格区域2、按CTRL+H快捷键,弹出查找与替换对话框3、...

问题 hmmsearch的选择

像这种 从一个开始 后面两个 from to 就不一致的应该如何选择呀?

问题 基因组

老师用你们基因组注释的镜像和脚本进行EGGNOG注释一直提示里面没有tidyverse这个R包,请问应该如何解决。

文章 看懂变异记录结果文件(VCF)

...测序深度为18X;AF=0.1表示等位基因频率为0.1;BaseQRankSum:比较支持变异的碱基和支持参考基因组的碱基的质量,负值表示支持变异的碱基质量值不及支持参考基因组的。DP: read depth。样本在这个位置的reads覆盖度。ExcessHet:检测...

文章 使用python绘制卡方分布函数(一)

...我们用简单的python语言来实现卡方分布的计算,这个内容比较多,分两节说,这一节主要是基础语句首先看一下定义:假设k个随机变量相互独立,且服从标准正态分布(期望为0,方差为1),则其平方和服从自由度为k的卡方分...

问题 保守结构域

您好,当基因序列差异太大时,建议用保守结构域构建进化树。请问保守结构域该如何提取呢?不是蛋白结构域吧?