MA图简介 MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴，A一般做X轴。 M常对应...
根据RNAseq有参转录组数据自主分析课程 ，运行建立基因组索引命令时，报错，无法获取gene_length.txt文件，请问是什么原因？如何处理呢？另外，得到的exons.tsv和splicesites.tsv文件是空的，请问这种情况正常吗？ 运行代码：sh $scrip...
...层面。 做了蛋白质组学分析之后，随之而来的问题就是数据的深入和文章的撰写，这让很初学者都头痛不已。 这里，小编就用一篇今年发表在frontiers in plant science的蛋白质组学文章给大家讲解一下相应的文章思路。 灰霉病是...
Error in download.file(url, method = method, ...) : 无法打开URL'https://gdc.cancer.gov/files/public/file/gdc-client_v1.5.0_Windows_x64_0.zip' 此外: Warning message: In if (grepl("^https?://", url)) { : 条件的长度大于一，因此只能用其第一元素，还请各位大神帮帮忙...
...依赖关系，对于经常呈现离散、不连续分布的微生物群落数据而言尤其适用。 简单的说，随机森林就是用随机的方式建立一个森林，森林里面有很多的决策树，并且每棵树之间是没有关联的。得到一个森林后，当有一个新的样...
...omeMarker) library(ggplot2) #方便起见，直接使用该包自带的数据，构建一个phyloseq格式的数据 data(kostic_crc) #标准化数据并通过内置的差异分析方法计算 kostic_crc_small <- phyloseq::subset_taxa( kostic_crc, Phylum %in% c("Firmicutes") ) ...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
老师好！我想在注释细胞亚群之前提取不同Cluster的Marker基因，但课程讲解和提供的代码是先注释不同亚群再进行不同亚群Marker基因的提取，代码如下：Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \ ...