...出路径 其中一个重要的文件 也就是参数.mao文件的获取比较困难，蛋白序列、DNA序列以及建树基于的模型不同，具体的参数变换比较多，而linux下无法直接形成该文件，可以先借助Windows版megacc 先生成该文件。 1、由官网下载安...
老师您好，我的基因组有一条序列比较短，三千多bp，在进行GeMoMa 同源比对预测基因时，这条序列没有预测到，final_annotation.gff 和 gemoma.evm.format.gff3中都没有这条序列的注释信息，在运行 PASA更新时就会导致找不到这个基因序列...
有一些问题想咨询下问题1：怎么判断自己跑出来qRT-PCR数据是否可用？①比如Ct值大小是否有要求？多少合适？②SD有什么要求？问题2：qPCR比较两组差异时t test应用paired还是unpaird
在比较基因组学的时候，经常会听到“共线性”这个词，但是与其对应的有两个不同的概念，即 (1) synteny ： 同线性(synteny): 两个物种的几个同源基因分布在同一条染色体上，不需要考虑到基因之间的排布 (2) collinear 共线性...
1. ps列出用户的pid，然后依次kill掉，比较繁琐 kill -9 `ps -uf username |awk '{ print $2 }'|grep -v PID` 或 ps -ef | grep username | awk '{ print $2 }' | xargs kill -9 2. pkill方式 pkill -9 -u username 3. killall方式 killall -u username
...CRNATOOLS等。但是我最常用的是TCGAbiolinks包，因为该包更新比较快，同时也是直接下载官网数据保证准确性，同时该包下载数据可直接整理成表格并可在R语言中分析，利于进一步分析和挖掘。 详细使用说明见：https://www.omicsclass.co...
什么是siRNA ？ siRNA（small interfering RNA 小干扰RNA） 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基，通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰（RNAi） 在RNA干扰通路中，siRNA 通过与互补 mRNA 分子杂交干扰基...
老师，你好！我们实验室有一批很早之前的转录组数据，那时公司提供的分析内容很少，而且用的基因组版本也比较久，我想重新分析一遍可以吗？
...一开始，我的工作流是这样的，我觉得需求的产出和规划比较重要，所以对于自己的文档和表达无比自信，我觉得我只需要做好下面的事情： 知会各个团队需求意向 开会对需求 写文档提需求 对接开发讲需求 每两周追一下...
我有两个水稻的突变体，分别是用EMS诱导突变的，和tDNA插入突变的，目前都构建了F2代，呈现出明显的3:1分离，应该是个质量性状。请问采用什么测序手段能够比较好的做出定位区间呢？
MA图简介 MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴，A一般做X轴。 M常对应...
...最终发现模块2与模块3，模块3与模块4，模块3与模块8具备比较高的关联(如下图）。 富集分析 分别对8个模块的基因进行GO和KEGG富集分析，并取p值小于0.05的前5个GO terms 或者KEGG pathways，汇总，以富集程度大小绘制如下热图，由...
...，还需要了解作图群体，这部分内容可以参考“作图群体如何选择？”这篇文章（蓝色字体可以点击）。 如果您近期有遗传图谱构建及QTL定位的计划，您大可和我们联系，我们将派专人给您制定详细的实验计划，以期得到一张...
...化； 字节跳动：字节范儿，极客，务实的浪漫主义。 如何推动事情 腾讯：内部 BD 资源； 阿里：跟你谈梦想； 字节跳动：拉个群，谁行谁上。 当和 leader 意见不同时 腾讯：" 这是上面老板说的 "； 阿里：" 我们要拥抱...
...表，做好高级个性化分析发表高分1区不是梦！T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接：T2T基因组组装与注释分析；动植物泛基因组分析 ；比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章，篇篇10+分，缩短分析周期，...