问题 植物叶绿体组装后，发现结果不成环状，要怎样调整其成环呢

组装的方法是GetOrganelle，运行结果如下

问题 在容器中设置工作路径始终显示找不到内容，调整好多次了，还是不行

问题 请问root会影响环境变量吗？

...。 我之前看帖子，有位老师说装软件要切换到root，这样比较好 请问root会影响环境变量吗？ 怎么调整呢？ 谢谢老师

问题 基因家族分析中基因家族成员的筛选与取舍如何判断？

...基因名但是基因序列完全相同的情况，不清楚该如何取舍比较科学，具体又该如何操作？

文章 ggplot2位置调整position

ggplot2 的geom()函数（几何对象）中常涉及图形元素的位置调整position，通过不同的参数调整可以使图片呈现不同的效果，主要的位置调整涉及如下方式： position 描述 dodge 避免重叠，并排放置 fill 堆叠图形元素并将高度标准...

文章 哪种生物信息学习方式最适合你？

...习的积极影响也是不可忽略的。 直播没有明显的缺点，比较均衡，可能会是今后的主流方式。 适合人群建议 好了，上面就是小编对4种学习方式的优劣势总结，下面针对各类人群给出我们的选择建议：  如果您时间特别充足...

文章 VIP-转录组数据鉴定病毒

...新病毒：这个模式是将转录组的序列与病毒的核酸库进行比较，再与病毒的蛋白库进行比较，这样能发现一些蛋白序列保守，但是核酸序列可能差别较大的病毒。 VIP的分析策略图如下： 使用该软件一个几个问题需要说明： 1...

文章 研究“屁”的论文：怎样给论文取一个好标题？

...的题目进行分析，其中对论文题目的长度和引用次数进行比较发现，论文题目越短，被引用的次数越多。该研究发表在Royal Society Open Science。 除了短之外，还有一个要点，就是要“小”。 中国人喜欢从大处着眼，以致大到无...

问题 经旋转调整后evolview进化树依然出现分支节点跟mega11不匹配的问题

文章 正选择分析之 Site Models

...下正选择基因。通常的做法是计算Ka/Ks，但是这种方法是比较严格的，因为正选择通常在短时间内作用于基因的几个位点，并且会被其余位点上的负选择抵消。因此，会使用其它一些方法来计算正选择基因，比如今天小编要说的S...

问题 泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

运行core_pan_gene_compare.r ，报错Error in contrasts<-(*tmp*, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels Calls: aov ... model.matrix.terms -> model.matrix.default -> contrasts<- Execution halted。我在泛基因组分类的...

文章 如何预测同一基因不同转录本对应蛋白的功能域差异

...常好用的数据库—Uniprot蛋白数据库。 以目植物中前研究比较热的明星基因“FLC”为例，为大家演示操作过程。 首先在Uniprot网站（https://www.uniprot.org/）检索框输入基因名称，点击检索后如下，数据库会在页面左侧展示存在该基...

文章 2022年最新2区纯转录组文章如何写作？

...生物学重复，在这部分数据介绍时依然是传统套路，整体比较不同品种间或不同发育阶段间的差异表达基因数及基因功能注释差异。时间倒退六七年，写到这里再做个qPCR就可以发文章，不过现在可不行了，继续看看作者如何行...

问题 拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

文章 拿到转录组分析结果后还应该干点什么？

...己只要几分钟就能搞定了。 3. 制作各个样品或者多个比较组之间的韦恩图（venn图），公司通常只给了几个比较组间的韦恩图，但是我们还会需要各个样品间，以及自己筛选出来的几个基因集之间的韦恩图，同样的找公司做要...