问题 MEME motif 统计每条序列中motif的种类

老师，您好。我在做基因家族motif分析时，除了以图片形式直观展示motif分布以外，还想统计一下每条序列中motif的分布情况。请问该如何批量操作？ 在得到的结果文件中，有看到下图所示的motif信息。[ ]之间的括号以外的数字...

文章 利用Hiplot网站进行热图绘制

在生信分析的过程中绘制热图可以直观呈现多样本多基因的全局表达量变化，也可以呈现多样本或多基因表达量的聚类关系。 而绘制生信热图的方法有很多，常用的有MeV软件、Excel、R语言ggplots绘图等等，今天给大家介绍如何在...

文章 总结：组织芯片在肿瘤研究中的应用及制备步骤

...术在肿瘤中日益广泛应用，肿瘤组织的基因测序及DNA序列分析已经不是瓶颈。基因研究的重点已从结构转向功能，技术需求同时对多个患者的肿瘤样本在同一水平进行免疫组织化学染色及原位杂交等操作。 传统的肿瘤组织切片...

文章 玉米根尖热处理单细胞数据分析

...R1070726 CK HS1 EW01 CRR1070727 HS HS2 EW02 CRR1070728 HS 6. cellranger 分析 cat ../meta.tsv|sed '1d'|while read SampleID Run Accession Group;do  echo "Processing $SampleID"  cellranger count --id=$SampleID \   --fastqs=$datadir/ \   --sample=$SampleID \   --localcores 20 --create-ba...

问题 circos基因位置不正确

老师您好，就是我在绘制circos图时就是每个基因的位置都是在染色体的最头上，我看了下课程上的文件格式和我的也是一样的，不知道是什么原因，请老师解答。

文章 免疫疫微环境（TIME）

...TIMER2.0 TIMER2.0 (http://timer.cistrome.org/) 是TIMER软件的更新版本，作为一个可交互式web工具，能够全面、灵活的分析肿瘤免疫浸润免疫细胞并可视化。另外相关文章也是发表在了Nucleic Acids Research（IF=11.1）杂志上。 现有用于...

问题 circos圈图内部线不显示

我看了下染色体对应问题，都是对应的，不知道为什么报错，请老师指点，谢谢

问题 mcmctree和cafe不显示分化时间

请问各位，我的mcmctree和cafe一起的图只显示家族的信息，不显示分化时间是怎么回事啊？

问题 win10无法正常启动大于1G内存的GSEA

...8g,虚拟内存12G左右；我已经安装乐JAVA8，是java网站推荐的版本，32位，但我的计算机是64位）

问题 老师你好，之前看组学大讲堂关于基因下载的视频，照着步骤做，但是在下载数据的时候一直报错，不知道是什么原因呢？不知道能不能帮忙看一下？谢谢

问题 如果提取基因一条代表CDS序列不成功，mRNA与CDS，GENE的ID都不一致（马铃薯数据库）

...本.rar（geneid_to_mRNAid.pl为原脚本，另外两个为修改后运行不成功的脚本）

问题 使用qiime2导入数据时，一直报错，不知怎么解决。万分感激！！

老师们你好，我在使用docker做qiime2分析自己的数据时，讲数据导入qiime2这一步时，报错了，manifest文件按照视频里做的，找了很多原因一直都是同样的报错代码，不知道怎么办。麻烦老师可以指教下吗？？

问题 二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

...bcftools merge合并的结果，缺失率太大，导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行，survivor merge 1000 1 1 0 0 50，合并后样本名减少，并且计算Fst为几个固定值。不知道要如何处理，希望能收到答复。谢谢

文章 三分钟让你理解什么是敏捷开发，这才是敏捷开发......

...站立会，确认各团队之间测试遇到的问题，如环境问题、版本问题等，提高测试效率，保证上线时间和上线质量，不要因为测试不充分出现上线后回滚的问题。 2.4 项目监控 项目监控，是保证项目进度，保证项目可以在...

问题 能开发票不？

所有的课程都能开发票么？